Protein–RNA interactions for Protein: O35309

Nmi, N-myc-interactor, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NmiO35309 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
NmiO35309 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NmiO35309 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NmiO35309 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NmiO35309 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NmiO35309 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NmiO35309 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
NmiO35309 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NmiO35309 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NmiO35309 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NmiO35309 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NmiO35309 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
NmiO35309 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NmiO35309 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NmiO35309 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NmiO35309 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NmiO35309 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NmiO35309 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NmiO35309 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NmiO35309 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NmiO35309 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NmiO35309 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NmiO35309 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NmiO35309 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NmiO35309 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NmiO35309 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NmiO35309 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NmiO35309 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NmiO35309 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NmiO35309 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NmiO35309 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NmiO35309 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NmiO35309 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NmiO35309 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
NmiO35309 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NmiO35309 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NmiO35309 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
NmiO35309 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
NmiO35309 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NmiO35309 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NmiO35309 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NmiO35309 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NmiO35309 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NmiO35309 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NmiO35309 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NmiO35309 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NmiO35309 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NmiO35309 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NmiO35309 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NmiO35309 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NmiO35309 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NmiO35309 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NmiO35309 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NmiO35309 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
NmiO35309 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NmiO35309 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NmiO35309 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NmiO35309 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NmiO35309 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NmiO35309 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NmiO35309 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NmiO35309 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NmiO35309 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NmiO35309 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NmiO35309 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NmiO35309 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NmiO35309 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NmiO35309 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NmiO35309 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NmiO35309 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NmiO35309 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NmiO35309 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NmiO35309 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NmiO35309 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NmiO35309 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
NmiO35309 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NmiO35309 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NmiO35309 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NmiO35309 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NmiO35309 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
NmiO35309 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NmiO35309 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NmiO35309 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NmiO35309 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NmiO35309 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NmiO35309 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NmiO35309 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NmiO35309 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NmiO35309 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NmiO35309 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NmiO35309 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NmiO35309 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NmiO35309 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NmiO35309 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NmiO35309 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
NmiO35309 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NmiO35309 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
NmiO35309 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NmiO35309 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NmiO35309 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms