Protein–RNA interactions for Protein: O35304

Slc18a3, Vesicular acetylcholine transporter, mousemouse

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc18a3O35304 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc18a3O35304 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc18a3O35304 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc18a3O35304 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc18a3O35304 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc18a3O35304 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc18a3O35304 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc18a3O35304 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc18a3O35304 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc18a3O35304 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc18a3O35304 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc18a3O35304 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc18a3O35304 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc18a3O35304 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc18a3O35304 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc18a3O35304 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc18a3O35304 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc18a3O35304 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc18a3O35304 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc18a3O35304 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc18a3O35304 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc18a3O35304 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc18a3O35304 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc18a3O35304 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Slc18a3O35304 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Slc18a3O35304 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Slc18a3O35304 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Slc18a3O35304 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Slc18a3O35304 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc18a3O35304 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc18a3O35304 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc18a3O35304 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc18a3O35304 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc18a3O35304 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc18a3O35304 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc18a3O35304 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc18a3O35304 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc18a3O35304 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc18a3O35304 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc18a3O35304 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc18a3O35304 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc18a3O35304 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc18a3O35304 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc18a3O35304 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc18a3O35304 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc18a3O35304 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Slc18a3O35304 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Slc18a3O35304 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Slc18a3O35304 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Slc18a3O35304 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Slc18a3O35304 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Slc18a3O35304 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Slc18a3O35304 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Slc18a3O35304 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Slc18a3O35304 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Slc18a3O35304 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Slc18a3O35304 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Slc18a3O35304 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Slc18a3O35304 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Slc18a3O35304 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Slc18a3O35304 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Slc18a3O35304 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Slc18a3O35304 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Slc18a3O35304 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Slc18a3O35304 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Slc18a3O35304 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Slc18a3O35304 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Slc18a3O35304 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Slc18a3O35304 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Slc18a3O35304 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Slc18a3O35304 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Slc18a3O35304 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Slc18a3O35304 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Slc18a3O35304 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Slc18a3O35304 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Slc18a3O35304 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Slc18a3O35304 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Slc18a3O35304 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Slc18a3O35304 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Slc18a3O35304 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Slc18a3O35304 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Slc18a3O35304 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Slc18a3O35304 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Slc18a3O35304 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Slc18a3O35304 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Slc18a3O35304 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Slc18a3O35304 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Slc18a3O35304 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Slc18a3O35304 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Slc18a3O35304 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Slc18a3O35304 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Slc18a3O35304 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Slc18a3O35304 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Slc18a3O35304 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Slc18a3O35304 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Slc18a3O35304 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Slc18a3O35304 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Slc18a3O35304 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Slc18a3O35304 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Slc18a3O35304 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms