Protein–RNA interactions for Protein: O35245

Pkd2, Polycystin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2O35245 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Pkd2O35245 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Pkd2O35245 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Pkd2O35245 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Pkd2O35245 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Pkd2O35245 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Pkd2O35245 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Pkd2O35245 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Pkd2O35245 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Pkd2O35245 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Pkd2O35245 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Pkd2O35245 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Pkd2O35245 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Pkd2O35245 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Pkd2O35245 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Pkd2O35245 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Pkd2O35245 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Pkd2O35245 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Pkd2O35245 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Pkd2O35245 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Pkd2O35245 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Pkd2O35245 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Pkd2O35245 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Pkd2O35245 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Pkd2O35245 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Pkd2O35245 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Pkd2O35245 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Pkd2O35245 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Pkd2O35245 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Pkd2O35245 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Pkd2O35245 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Pkd2O35245 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Pkd2O35245 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Pkd2O35245 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Pkd2O35245 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Pkd2O35245 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Pkd2O35245 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Pkd2O35245 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Pkd2O35245 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Pkd2O35245 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Pkd2O35245 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Pkd2O35245 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Pkd2O35245 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Pkd2O35245 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Pkd2O35245 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Pkd2O35245 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Pkd2O35245 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Pkd2O35245 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Pkd2O35245 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Pkd2O35245 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Pkd2O35245 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Pkd2O35245 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Pkd2O35245 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Pkd2O35245 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Pkd2O35245 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Pkd2O35245 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Pkd2O35245 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Pkd2O35245 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Pkd2O35245 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Pkd2O35245 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Pkd2O35245 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Pkd2O35245 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Pkd2O35245 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Pkd2O35245 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Pkd2O35245 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Pkd2O35245 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Pkd2O35245 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Pkd2O35245 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Pkd2O35245 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Pkd2O35245 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Pkd2O35245 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Pkd2O35245 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Pkd2O35245 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Pkd2O35245 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Pkd2O35245 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Pkd2O35245 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Pkd2O35245 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Pkd2O35245 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Pkd2O35245 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Pkd2O35245 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Pkd2O35245 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Pkd2O35245 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Pkd2O35245 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Pkd2O35245 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Pkd2O35245 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Pkd2O35245 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Pkd2O35245 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Pkd2O35245 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Pkd2O35245 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Pkd2O35245 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Pkd2O35245 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Pkd2O35245 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Pkd2O35245 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Pkd2O35245 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Pkd2O35245 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Pkd2O35245 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Pkd2O35245 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Pkd2O35245 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Pkd2O35245 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Pkd2O35245 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms