Protein–RNA interactions for Protein: O08976

Pbsn, Probasin, mousemouse

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Length 174 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PbsnO08976 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PbsnO08976 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PbsnO08976 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PbsnO08976 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PbsnO08976 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PbsnO08976 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PbsnO08976 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PbsnO08976 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PbsnO08976 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PbsnO08976 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PbsnO08976 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PbsnO08976 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PbsnO08976 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PbsnO08976 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PbsnO08976 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PbsnO08976 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PbsnO08976 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PbsnO08976 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PbsnO08976 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PbsnO08976 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PbsnO08976 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PbsnO08976 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PbsnO08976 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PbsnO08976 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PbsnO08976 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PbsnO08976 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PbsnO08976 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PbsnO08976 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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PbsnO08976 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PbsnO08976 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PbsnO08976 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PbsnO08976 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PbsnO08976 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PbsnO08976 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PbsnO08976 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PbsnO08976 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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PbsnO08976 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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PbsnO08976 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
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PbsnO08976 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PbsnO08976 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PbsnO08976 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PbsnO08976 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
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PbsnO08976 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PbsnO08976 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
PbsnO08976 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
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PbsnO08976 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
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PbsnO08976 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PbsnO08976 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
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PbsnO08976 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
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PbsnO08976 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
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PbsnO08976 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PbsnO08976 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PbsnO08976 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PbsnO08976 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PbsnO08976 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PbsnO08976 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PbsnO08976 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PbsnO08976 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PbsnO08976 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PbsnO08976 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PbsnO08976 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PbsnO08976 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PbsnO08976 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PbsnO08976 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PbsnO08976 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PbsnO08976 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PbsnO08976 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PbsnO08976 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms