Protein–RNA interactions for Protein: O08784

Tcof1, Treacle protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,320 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcof1O08784 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tcof1O08784 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tcof1O08784 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tcof1O08784 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tcof1O08784 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tcof1O08784 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tcof1O08784 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tcof1O08784 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tcof1O08784 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tcof1O08784 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tcof1O08784 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Tcof1O08784 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tcof1O08784 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tcof1O08784 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tcof1O08784 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Tcof1O08784 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Tcof1O08784 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tcof1O08784 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tcof1O08784 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tcof1O08784 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tcof1O08784 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tcof1O08784 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tcof1O08784 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tcof1O08784 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tcof1O08784 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tcof1O08784 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tcof1O08784 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tcof1O08784 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tcof1O08784 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tcof1O08784 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tcof1O08784 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tcof1O08784 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tcof1O08784 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tcof1O08784 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tcof1O08784 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tcof1O08784 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tcof1O08784 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tcof1O08784 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tcof1O08784 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tcof1O08784 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tcof1O08784 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Tcof1O08784 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tcof1O08784 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tcof1O08784 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tcof1O08784 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tcof1O08784 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tcof1O08784 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tcof1O08784 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tcof1O08784 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tcof1O08784 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tcof1O08784 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tcof1O08784 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tcof1O08784 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tcof1O08784 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tcof1O08784 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Tcof1O08784 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tcof1O08784 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tcof1O08784 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tcof1O08784 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tcof1O08784 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tcof1O08784 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tcof1O08784 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tcof1O08784 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tcof1O08784 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tcof1O08784 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tcof1O08784 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tcof1O08784 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tcof1O08784 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tcof1O08784 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tcof1O08784 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tcof1O08784 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tcof1O08784 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tcof1O08784 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tcof1O08784 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tcof1O08784 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tcof1O08784 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tcof1O08784 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tcof1O08784 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tcof1O08784 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tcof1O08784 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tcof1O08784 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tcof1O08784 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tcof1O08784 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tcof1O08784 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tcof1O08784 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Tcof1O08784 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tcof1O08784 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tcof1O08784 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tcof1O08784 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tcof1O08784 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tcof1O08784 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tcof1O08784 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
Tcof1O08784 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tcof1O08784 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Tcof1O08784 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Tcof1O08784 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tcof1O08784 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tcof1O08784 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tcof1O08784 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tcof1O08784 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
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