Protein–RNA interactions for Protein: O08585

Clta, Clathrin light chain A, mousemouse

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Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltaO08585 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CltaO08585 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CltaO08585 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CltaO08585 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CltaO08585 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CltaO08585 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CltaO08585 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CltaO08585 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CltaO08585 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CltaO08585 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CltaO08585 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CltaO08585 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CltaO08585 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CltaO08585 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CltaO08585 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CltaO08585 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CltaO08585 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CltaO08585 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CltaO08585 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CltaO08585 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CltaO08585 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CltaO08585 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CltaO08585 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CltaO08585 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CltaO08585 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CltaO08585 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CltaO08585 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CltaO08585 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CltaO08585 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CltaO08585 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CltaO08585 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CltaO08585 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CltaO08585 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CltaO08585 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CltaO08585 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CltaO08585 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CltaO08585 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CltaO08585 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CltaO08585 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CltaO08585 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CltaO08585 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CltaO08585 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CltaO08585 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CltaO08585 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CltaO08585 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CltaO08585 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CltaO08585 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CltaO08585 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CltaO08585 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CltaO08585 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CltaO08585 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CltaO08585 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CltaO08585 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CltaO08585 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CltaO08585 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CltaO08585 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CltaO08585 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CltaO08585 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CltaO08585 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CltaO08585 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CltaO08585 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CltaO08585 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CltaO08585 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CltaO08585 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CltaO08585 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CltaO08585 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CltaO08585 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CltaO08585 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CltaO08585 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CltaO08585 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CltaO08585 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CltaO08585 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CltaO08585 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CltaO08585 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CltaO08585 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CltaO08585 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CltaO08585 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CltaO08585 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CltaO08585 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CltaO08585 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CltaO08585 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CltaO08585 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CltaO08585 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CltaO08585 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CltaO08585 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CltaO08585 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CltaO08585 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CltaO08585 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CltaO08585 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CltaO08585 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CltaO08585 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CltaO08585 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CltaO08585 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CltaO08585 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CltaO08585 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CltaO08585 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CltaO08585 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CltaO08585 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CltaO08585 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CltaO08585 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms