Protein–RNA interactions for Protein: J3QPU5

Ccer2, Coiled-coil glutamate-rich protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer2J3QPU5 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ccer2J3QPU5 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ccer2J3QPU5 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ccer2J3QPU5 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ccer2J3QPU5 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ccer2J3QPU5 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ccer2J3QPU5 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ccer2J3QPU5 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Ccer2J3QPU5 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ccer2J3QPU5 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ccer2J3QPU5 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ccer2J3QPU5 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ccer2J3QPU5 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ccer2J3QPU5 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ccer2J3QPU5 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ccer2J3QPU5 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ccer2J3QPU5 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ccer2J3QPU5 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ccer2J3QPU5 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ccer2J3QPU5 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ccer2J3QPU5 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ccer2J3QPU5 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ccer2J3QPU5 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ccer2J3QPU5 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ccer2J3QPU5 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ccer2J3QPU5 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ccer2J3QPU5 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ccer2J3QPU5 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ccer2J3QPU5 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Ccer2J3QPU5 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ccer2J3QPU5 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ccer2J3QPU5 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ccer2J3QPU5 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ccer2J3QPU5 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ccer2J3QPU5 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ccer2J3QPU5 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Ccer2J3QPU5 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ccer2J3QPU5 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ccer2J3QPU5 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ccer2J3QPU5 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ccer2J3QPU5 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ccer2J3QPU5 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Ccer2J3QPU5 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ccer2J3QPU5 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Ccer2J3QPU5 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ccer2J3QPU5 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ccer2J3QPU5 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ccer2J3QPU5 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ccer2J3QPU5 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ccer2J3QPU5 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ccer2J3QPU5 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ccer2J3QPU5 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ccer2J3QPU5 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ccer2J3QPU5 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ccer2J3QPU5 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ccer2J3QPU5 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ccer2J3QPU5 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ccer2J3QPU5 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ccer2J3QPU5 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ccer2J3QPU5 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ccer2J3QPU5 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ccer2J3QPU5 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ccer2J3QPU5 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ccer2J3QPU5 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ccer2J3QPU5 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ccer2J3QPU5 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ccer2J3QPU5 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ccer2J3QPU5 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ccer2J3QPU5 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ccer2J3QPU5 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ccer2J3QPU5 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Ccer2J3QPU5 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Ccer2J3QPU5 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Ccer2J3QPU5 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ccer2J3QPU5 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ccer2J3QPU5 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ccer2J3QPU5 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ccer2J3QPU5 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ccer2J3QPU5 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ccer2J3QPU5 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ccer2J3QPU5 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ccer2J3QPU5 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ccer2J3QPU5 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ccer2J3QPU5 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ccer2J3QPU5 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ccer2J3QPU5 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ccer2J3QPU5 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Ccer2J3QPU5 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Ccer2J3QPU5 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ccer2J3QPU5 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Ccer2J3QPU5 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ccer2J3QPU5 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ccer2J3QPU5 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ccer2J3QPU5 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ccer2J3QPU5 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ccer2J3QPU5 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ccer2J3QPU5 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ccer2J3QPU5 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ccer2J3QPU5 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Ccer2J3QPU5 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms