Protein–RNA interactions for Protein: J3QPL3

Gm5225, Predicted gene 5225, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5225J3QPL3 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm5225J3QPL3 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm5225J3QPL3 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm5225J3QPL3 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm5225J3QPL3 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm5225J3QPL3 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm5225J3QPL3 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm5225J3QPL3 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm5225J3QPL3 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm5225J3QPL3 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm5225J3QPL3 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm5225J3QPL3 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm5225J3QPL3 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm5225J3QPL3 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm5225J3QPL3 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm5225J3QPL3 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm5225J3QPL3 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm5225J3QPL3 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm5225J3QPL3 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm5225J3QPL3 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm5225J3QPL3 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm5225J3QPL3 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm5225J3QPL3 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm5225J3QPL3 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm5225J3QPL3 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm5225J3QPL3 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm5225J3QPL3 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm5225J3QPL3 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm5225J3QPL3 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm5225J3QPL3 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm5225J3QPL3 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm5225J3QPL3 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm5225J3QPL3 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm5225J3QPL3 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm5225J3QPL3 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm5225J3QPL3 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm5225J3QPL3 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm5225J3QPL3 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm5225J3QPL3 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm5225J3QPL3 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm5225J3QPL3 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm5225J3QPL3 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm5225J3QPL3 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm5225J3QPL3 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm5225J3QPL3 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm5225J3QPL3 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm5225J3QPL3 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm5225J3QPL3 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm5225J3QPL3 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm5225J3QPL3 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm5225J3QPL3 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm5225J3QPL3 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm5225J3QPL3 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm5225J3QPL3 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm5225J3QPL3 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm5225J3QPL3 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm5225J3QPL3 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm5225J3QPL3 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm5225J3QPL3 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm5225J3QPL3 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm5225J3QPL3 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm5225J3QPL3 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm5225J3QPL3 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm5225J3QPL3 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm5225J3QPL3 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm5225J3QPL3 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm5225J3QPL3 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gm5225J3QPL3 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Gm5225J3QPL3 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gm5225J3QPL3 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm5225J3QPL3 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm5225J3QPL3 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm5225J3QPL3 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm5225J3QPL3 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm5225J3QPL3 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm5225J3QPL3 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm5225J3QPL3 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm5225J3QPL3 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm5225J3QPL3 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm5225J3QPL3 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm5225J3QPL3 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm5225J3QPL3 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm5225J3QPL3 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm5225J3QPL3 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm5225J3QPL3 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm5225J3QPL3 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm5225J3QPL3 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm5225J3QPL3 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm5225J3QPL3 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm5225J3QPL3 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm5225J3QPL3 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm5225J3QPL3 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm5225J3QPL3 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm5225J3QPL3 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm5225J3QPL3 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm5225J3QPL3 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm5225J3QPL3 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm5225J3QPL3 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm5225J3QPL3 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm5225J3QPL3 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms