Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smim18J3QNP2 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smim18J3QNP2 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smim18J3QNP2 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smim18J3QNP2 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smim18J3QNP2 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smim18J3QNP2 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smim18J3QNP2 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smim18J3QNP2 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smim18J3QNP2 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smim18J3QNP2 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smim18J3QNP2 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smim18J3QNP2 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smim18J3QNP2 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smim18J3QNP2 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smim18J3QNP2 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smim18J3QNP2 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smim18J3QNP2 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Smim18J3QNP2 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smim18J3QNP2 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smim18J3QNP2 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smim18J3QNP2 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smim18J3QNP2 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Smim18J3QNP2 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smim18J3QNP2 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smim18J3QNP2 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smim18J3QNP2 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smim18J3QNP2 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Smim18J3QNP2 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smim18J3QNP2 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smim18J3QNP2 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smim18J3QNP2 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smim18J3QNP2 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smim18J3QNP2 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smim18J3QNP2 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smim18J3QNP2 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smim18J3QNP2 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smim18J3QNP2 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smim18J3QNP2 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smim18J3QNP2 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Smim18J3QNP2 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Smim18J3QNP2 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Smim18J3QNP2 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smim18J3QNP2 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smim18J3QNP2 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smim18J3QNP2 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smim18J3QNP2 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smim18J3QNP2 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smim18J3QNP2 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smim18J3QNP2 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smim18J3QNP2 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smim18J3QNP2 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smim18J3QNP2 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smim18J3QNP2 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smim18J3QNP2 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smim18J3QNP2 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smim18J3QNP2 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smim18J3QNP2 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smim18J3QNP2 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smim18J3QNP2 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smim18J3QNP2 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smim18J3QNP2 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smim18J3QNP2 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smim18J3QNP2 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smim18J3QNP2 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smim18J3QNP2 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smim18J3QNP2 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smim18J3QNP2 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smim18J3QNP2 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smim18J3QNP2 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smim18J3QNP2 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smim18J3QNP2 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smim18J3QNP2 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smim18J3QNP2 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smim18J3QNP2 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smim18J3QNP2 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smim18J3QNP2 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smim18J3QNP2 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smim18J3QNP2 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smim18J3QNP2 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smim18J3QNP2 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smim18J3QNP2 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smim18J3QNP2 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smim18J3QNP2 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smim18J3QNP2 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smim18J3QNP2 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smim18J3QNP2 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smim18J3QNP2 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smim18J3QNP2 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smim18J3QNP2 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smim18J3QNP2 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smim18J3QNP2 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smim18J3QNP2 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smim18J3QNP2 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Smim18J3QNP2 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smim18J3QNP2 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smim18J3QNP2 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smim18J3QNP2 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smim18J3QNP2 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smim18J3QNP2 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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