Protein–RNA interactions for Protein: J3QNH3

Gm21788, Predicted gene, 21788, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21788J3QNH3 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm21788J3QNH3 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm21788J3QNH3 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm21788J3QNH3 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm21788J3QNH3 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm21788J3QNH3 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm21788J3QNH3 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm21788J3QNH3 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm21788J3QNH3 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm21788J3QNH3 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm21788J3QNH3 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm21788J3QNH3 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm21788J3QNH3 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm21788J3QNH3 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm21788J3QNH3 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm21788J3QNH3 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm21788J3QNH3 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm21788J3QNH3 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm21788J3QNH3 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm21788J3QNH3 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm21788J3QNH3 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm21788J3QNH3 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm21788J3QNH3 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm21788J3QNH3 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm21788J3QNH3 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm21788J3QNH3 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm21788J3QNH3 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21788J3QNH3 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21788J3QNH3 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21788J3QNH3 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21788J3QNH3 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21788J3QNH3 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21788J3QNH3 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21788J3QNH3 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21788J3QNH3 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21788J3QNH3 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21788J3QNH3 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21788J3QNH3 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21788J3QNH3 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21788J3QNH3 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21788J3QNH3 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm21788J3QNH3 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21788J3QNH3 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21788J3QNH3 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21788J3QNH3 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21788J3QNH3 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21788J3QNH3 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21788J3QNH3 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21788J3QNH3 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21788J3QNH3 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21788J3QNH3 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21788J3QNH3 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21788J3QNH3 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21788J3QNH3 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21788J3QNH3 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21788J3QNH3 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21788J3QNH3 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21788J3QNH3 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21788J3QNH3 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21788J3QNH3 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm21788J3QNH3 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21788J3QNH3 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21788J3QNH3 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21788J3QNH3 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21788J3QNH3 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21788J3QNH3 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21788J3QNH3 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21788J3QNH3 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21788J3QNH3 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21788J3QNH3 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21788J3QNH3 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21788J3QNH3 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21788J3QNH3 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21788J3QNH3 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21788J3QNH3 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21788J3QNH3 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21788J3QNH3 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21788J3QNH3 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21788J3QNH3 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21788J3QNH3 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21788J3QNH3 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21788J3QNH3 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm21788J3QNH3 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21788J3QNH3 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21788J3QNH3 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21788J3QNH3 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21788J3QNH3 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21788J3QNH3 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21788J3QNH3 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21788J3QNH3 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21788J3QNH3 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21788J3QNH3 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21788J3QNH3 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21788J3QNH3 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21788J3QNH3 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21788J3QNH3 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21788J3QNH3 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21788J3QNH3 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm21788J3QNH3 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm21788J3QNH3 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms