Protein–RNA interactions for Protein: J3QNE4

Ccdc180, Coiled-coil domain-containing 180, mousemouse

Predictions only

Length 1,664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc180J3QNE4 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC33.46■■■□□ 2.95
Ccdc180J3QNE4 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Ccdc180J3QNE4 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
Ccdc180J3QNE4 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Ccdc180J3QNE4 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Ccdc180J3QNE4 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Ccdc180J3QNE4 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Ccdc180J3QNE4 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Ccdc180J3QNE4 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Ccdc180J3QNE4 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Ccdc180J3QNE4 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Ccdc180J3QNE4 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Ccdc180J3QNE4 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Ccdc180J3QNE4 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC33.44■■■□□ 2.94
Ccdc180J3QNE4 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Ccdc180J3QNE4 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Ccdc180J3QNE4 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Ccdc180J3QNE4 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Ccdc180J3QNE4 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Ccdc180J3QNE4 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Ccdc180J3QNE4 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Ccdc180J3QNE4 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Ccdc180J3QNE4 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Ccdc180J3QNE4 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Ccdc180J3QNE4 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
Ccdc180J3QNE4 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Ccdc180J3QNE4 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
Ccdc180J3QNE4 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
Ccdc180J3QNE4 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
Ccdc180J3QNE4 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Ccdc180J3QNE4 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Ccdc180J3QNE4 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Ccdc180J3QNE4 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
Ccdc180J3QNE4 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Ccdc180J3QNE4 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Ccdc180J3QNE4 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
Ccdc180J3QNE4 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Ccdc180J3QNE4 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Ccdc180J3QNE4 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC33.41■■■□□ 2.94
Ccdc180J3QNE4 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Ccdc180J3QNE4 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
Ccdc180J3QNE4 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
Ccdc180J3QNE4 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Ccdc180J3QNE4 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
Ccdc180J3QNE4 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Ccdc180J3QNE4 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Ccdc180J3QNE4 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Ccdc180J3QNE4 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
Ccdc180J3QNE4 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
Ccdc180J3QNE4 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
Ccdc180J3QNE4 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
Ccdc180J3QNE4 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Ccdc180J3QNE4 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.39■■■□□ 2.94
Ccdc180J3QNE4 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Ccdc180J3QNE4 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Ccdc180J3QNE4 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Ccdc180J3QNE4 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Ccdc180J3QNE4 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Ccdc180J3QNE4 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Ccdc180J3QNE4 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Ccdc180J3QNE4 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
Ccdc180J3QNE4 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Ccdc180J3QNE4 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Ccdc180J3QNE4 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
Ccdc180J3QNE4 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
Ccdc180J3QNE4 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Ccdc180J3QNE4 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
Ccdc180J3QNE4 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Ccdc180J3QNE4 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Ccdc180J3QNE4 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Ccdc180J3QNE4 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
Ccdc180J3QNE4 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Ccdc180J3QNE4 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Ccdc180J3QNE4 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.36■■■□□ 2.93
Ccdc180J3QNE4 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Ccdc180J3QNE4 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Ccdc180J3QNE4 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Ccdc180J3QNE4 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Ccdc180J3QNE4 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Ccdc180J3QNE4 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
Ccdc180J3QNE4 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Ccdc180J3QNE4 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
Ccdc180J3QNE4 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Ccdc180J3QNE4 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
Ccdc180J3QNE4 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Ccdc180J3QNE4 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Ccdc180J3QNE4 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
Ccdc180J3QNE4 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
Ccdc180J3QNE4 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
Ccdc180J3QNE4 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
Ccdc180J3QNE4 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Ccdc180J3QNE4 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
Ccdc180J3QNE4 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Ccdc180J3QNE4 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Ccdc180J3QNE4 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Ccdc180J3QNE4 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Ccdc180J3QNE4 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC33.32■■■□□ 2.93
Ccdc180J3QNE4 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Ccdc180J3QNE4 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Ccdc180J3QNE4 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms