Protein–RNA interactions for Protein: J3KMI7

Gm20828, MCG116667, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20828J3KMI7 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm20828J3KMI7 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm20828J3KMI7 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm20828J3KMI7 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm20828J3KMI7 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm20828J3KMI7 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm20828J3KMI7 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm20828J3KMI7 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm20828J3KMI7 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm20828J3KMI7 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm20828J3KMI7 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm20828J3KMI7 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm20828J3KMI7 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm20828J3KMI7 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm20828J3KMI7 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm20828J3KMI7 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm20828J3KMI7 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm20828J3KMI7 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm20828J3KMI7 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm20828J3KMI7 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm20828J3KMI7 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm20828J3KMI7 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm20828J3KMI7 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm20828J3KMI7 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm20828J3KMI7 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm20828J3KMI7 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm20828J3KMI7 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm20828J3KMI7 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm20828J3KMI7 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm20828J3KMI7 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm20828J3KMI7 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm20828J3KMI7 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm20828J3KMI7 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm20828J3KMI7 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm20828J3KMI7 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm20828J3KMI7 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm20828J3KMI7 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm20828J3KMI7 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm20828J3KMI7 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm20828J3KMI7 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm20828J3KMI7 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm20828J3KMI7 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm20828J3KMI7 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm20828J3KMI7 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm20828J3KMI7 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm20828J3KMI7 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm20828J3KMI7 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm20828J3KMI7 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm20828J3KMI7 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm20828J3KMI7 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm20828J3KMI7 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm20828J3KMI7 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm20828J3KMI7 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm20828J3KMI7 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm20828J3KMI7 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm20828J3KMI7 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm20828J3KMI7 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm20828J3KMI7 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm20828J3KMI7 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm20828J3KMI7 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm20828J3KMI7 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm20828J3KMI7 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm20828J3KMI7 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm20828J3KMI7 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm20828J3KMI7 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm20828J3KMI7 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm20828J3KMI7 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm20828J3KMI7 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm20828J3KMI7 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm20828J3KMI7 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm20828J3KMI7 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm20828J3KMI7 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm20828J3KMI7 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm20828J3KMI7 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm20828J3KMI7 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm20828J3KMI7 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm20828J3KMI7 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm20828J3KMI7 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm20828J3KMI7 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm20828J3KMI7 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm20828J3KMI7 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm20828J3KMI7 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm20828J3KMI7 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm20828J3KMI7 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm20828J3KMI7 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm20828J3KMI7 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm20828J3KMI7 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm20828J3KMI7 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm20828J3KMI7 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm20828J3KMI7 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm20828J3KMI7 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm20828J3KMI7 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm20828J3KMI7 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm20828J3KMI7 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm20828J3KMI7 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm20828J3KMI7 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm20828J3KMI7 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm20828J3KMI7 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm20828J3KMI7 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm20828J3KMI7 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms