Protein–RNA interactions for Protein: G5E8P0

Tubgcp6, Gamma-tubulin complex component 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp6G5E8P0 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Tubgcp6G5E8P0 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
Tubgcp6G5E8P0 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Tubgcp6G5E8P0 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Tubgcp6G5E8P0 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Tubgcp6G5E8P0 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Tubgcp6G5E8P0 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Tubgcp6G5E8P0 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Tubgcp6G5E8P0 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Tubgcp6G5E8P0 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Tubgcp6G5E8P0 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Tubgcp6G5E8P0 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tubgcp6G5E8P0 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tubgcp6G5E8P0 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tubgcp6G5E8P0 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tubgcp6G5E8P0 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tubgcp6G5E8P0 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tubgcp6G5E8P0 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tubgcp6G5E8P0 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tubgcp6G5E8P0 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tubgcp6G5E8P0 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tubgcp6G5E8P0 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tubgcp6G5E8P0 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tubgcp6G5E8P0 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tubgcp6G5E8P0 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Tubgcp6G5E8P0 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tubgcp6G5E8P0 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tubgcp6G5E8P0 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tubgcp6G5E8P0 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tubgcp6G5E8P0 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tubgcp6G5E8P0 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tubgcp6G5E8P0 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tubgcp6G5E8P0 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tubgcp6G5E8P0 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tubgcp6G5E8P0 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tubgcp6G5E8P0 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Tubgcp6G5E8P0 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tubgcp6G5E8P0 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tubgcp6G5E8P0 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tubgcp6G5E8P0 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tubgcp6G5E8P0 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tubgcp6G5E8P0 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tubgcp6G5E8P0 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tubgcp6G5E8P0 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tubgcp6G5E8P0 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tubgcp6G5E8P0 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tubgcp6G5E8P0 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tubgcp6G5E8P0 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tubgcp6G5E8P0 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Tubgcp6G5E8P0 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tubgcp6G5E8P0 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tubgcp6G5E8P0 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tubgcp6G5E8P0 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tubgcp6G5E8P0 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tubgcp6G5E8P0 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tubgcp6G5E8P0 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Tubgcp6G5E8P0 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Tubgcp6G5E8P0 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Tubgcp6G5E8P0 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Tubgcp6G5E8P0 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Tubgcp6G5E8P0 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Tubgcp6G5E8P0 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Tubgcp6G5E8P0 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Tubgcp6G5E8P0 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Tubgcp6G5E8P0 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Tubgcp6G5E8P0 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
Tubgcp6G5E8P0 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Tubgcp6G5E8P0 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
Tubgcp6G5E8P0 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Tubgcp6G5E8P0 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Tubgcp6G5E8P0 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Tubgcp6G5E8P0 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Tubgcp6G5E8P0 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tubgcp6G5E8P0 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tubgcp6G5E8P0 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tubgcp6G5E8P0 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tubgcp6G5E8P0 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tubgcp6G5E8P0 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tubgcp6G5E8P0 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tubgcp6G5E8P0 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Tubgcp6G5E8P0 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tubgcp6G5E8P0 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tubgcp6G5E8P0 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tubgcp6G5E8P0 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tubgcp6G5E8P0 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tubgcp6G5E8P0 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tubgcp6G5E8P0 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tubgcp6G5E8P0 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tubgcp6G5E8P0 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tubgcp6G5E8P0 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Tubgcp6G5E8P0 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tubgcp6G5E8P0 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tubgcp6G5E8P0 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tubgcp6G5E8P0 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tubgcp6G5E8P0 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tubgcp6G5E8P0 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tubgcp6G5E8P0 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tubgcp6G5E8P0 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Tubgcp6G5E8P0 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tubgcp6G5E8P0 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms