Protein–RNA interactions for Protein: G3X9R7

Rnf148, RING finger protein 148, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf148G3X9R7 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnf148G3X9R7 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnf148G3X9R7 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnf148G3X9R7 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnf148G3X9R7 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnf148G3X9R7 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnf148G3X9R7 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnf148G3X9R7 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnf148G3X9R7 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Rnf148G3X9R7 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Rnf148G3X9R7 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Rnf148G3X9R7 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rnf148G3X9R7 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Rnf148G3X9R7 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rnf148G3X9R7 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rnf148G3X9R7 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rnf148G3X9R7 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rnf148G3X9R7 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Rnf148G3X9R7 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rnf148G3X9R7 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rnf148G3X9R7 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Rnf148G3X9R7 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rnf148G3X9R7 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rnf148G3X9R7 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rnf148G3X9R7 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rnf148G3X9R7 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rnf148G3X9R7 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rnf148G3X9R7 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rnf148G3X9R7 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnf148G3X9R7 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnf148G3X9R7 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnf148G3X9R7 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnf148G3X9R7 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnf148G3X9R7 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnf148G3X9R7 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnf148G3X9R7 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnf148G3X9R7 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnf148G3X9R7 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnf148G3X9R7 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnf148G3X9R7 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnf148G3X9R7 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnf148G3X9R7 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnf148G3X9R7 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnf148G3X9R7 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rnf148G3X9R7 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rnf148G3X9R7 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rnf148G3X9R7 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Rnf148G3X9R7 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rnf148G3X9R7 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rnf148G3X9R7 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rnf148G3X9R7 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rnf148G3X9R7 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rnf148G3X9R7 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rnf148G3X9R7 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rnf148G3X9R7 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rnf148G3X9R7 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rnf148G3X9R7 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rnf148G3X9R7 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rnf148G3X9R7 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rnf148G3X9R7 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Rnf148G3X9R7 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rnf148G3X9R7 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rnf148G3X9R7 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rnf148G3X9R7 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rnf148G3X9R7 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Rnf148G3X9R7 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rnf148G3X9R7 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rnf148G3X9R7 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rnf148G3X9R7 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rnf148G3X9R7 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rnf148G3X9R7 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rnf148G3X9R7 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Rnf148G3X9R7 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Rnf148G3X9R7 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rnf148G3X9R7 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rnf148G3X9R7 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rnf148G3X9R7 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rnf148G3X9R7 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rnf148G3X9R7 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rnf148G3X9R7 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rnf148G3X9R7 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rnf148G3X9R7 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rnf148G3X9R7 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rnf148G3X9R7 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rnf148G3X9R7 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rnf148G3X9R7 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rnf148G3X9R7 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rnf148G3X9R7 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rnf148G3X9R7 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Rnf148G3X9R7 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rnf148G3X9R7 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rnf148G3X9R7 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rnf148G3X9R7 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rnf148G3X9R7 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rnf148G3X9R7 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rnf148G3X9R7 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rnf148G3X9R7 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rnf148G3X9R7 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rnf148G3X9R7 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rnf148G3X9R7 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms