Protein–RNA interactions for Protein: G3X9M3

Hmgxb3, HMG box domain-containing 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgxb3G3X9M3 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hmgxb3G3X9M3 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hmgxb3G3X9M3 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hmgxb3G3X9M3 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hmgxb3G3X9M3 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hmgxb3G3X9M3 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hmgxb3G3X9M3 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hmgxb3G3X9M3 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hmgxb3G3X9M3 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hmgxb3G3X9M3 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hmgxb3G3X9M3 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hmgxb3G3X9M3 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hmgxb3G3X9M3 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hmgxb3G3X9M3 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hmgxb3G3X9M3 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hmgxb3G3X9M3 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hmgxb3G3X9M3 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Hmgxb3G3X9M3 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hmgxb3G3X9M3 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hmgxb3G3X9M3 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hmgxb3G3X9M3 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hmgxb3G3X9M3 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hmgxb3G3X9M3 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hmgxb3G3X9M3 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hmgxb3G3X9M3 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hmgxb3G3X9M3 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hmgxb3G3X9M3 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hmgxb3G3X9M3 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hmgxb3G3X9M3 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hmgxb3G3X9M3 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hmgxb3G3X9M3 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hmgxb3G3X9M3 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hmgxb3G3X9M3 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hmgxb3G3X9M3 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hmgxb3G3X9M3 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hmgxb3G3X9M3 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hmgxb3G3X9M3 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hmgxb3G3X9M3 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hmgxb3G3X9M3 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hmgxb3G3X9M3 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hmgxb3G3X9M3 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hmgxb3G3X9M3 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hmgxb3G3X9M3 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hmgxb3G3X9M3 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hmgxb3G3X9M3 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hmgxb3G3X9M3 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hmgxb3G3X9M3 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hmgxb3G3X9M3 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hmgxb3G3X9M3 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hmgxb3G3X9M3 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hmgxb3G3X9M3 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hmgxb3G3X9M3 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hmgxb3G3X9M3 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hmgxb3G3X9M3 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hmgxb3G3X9M3 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hmgxb3G3X9M3 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hmgxb3G3X9M3 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hmgxb3G3X9M3 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hmgxb3G3X9M3 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hmgxb3G3X9M3 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hmgxb3G3X9M3 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hmgxb3G3X9M3 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hmgxb3G3X9M3 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hmgxb3G3X9M3 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Hmgxb3G3X9M3 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hmgxb3G3X9M3 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hmgxb3G3X9M3 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hmgxb3G3X9M3 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hmgxb3G3X9M3 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hmgxb3G3X9M3 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hmgxb3G3X9M3 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Hmgxb3G3X9M3 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hmgxb3G3X9M3 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hmgxb3G3X9M3 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hmgxb3G3X9M3 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hmgxb3G3X9M3 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hmgxb3G3X9M3 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hmgxb3G3X9M3 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hmgxb3G3X9M3 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hmgxb3G3X9M3 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hmgxb3G3X9M3 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hmgxb3G3X9M3 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hmgxb3G3X9M3 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hmgxb3G3X9M3 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hmgxb3G3X9M3 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hmgxb3G3X9M3 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hmgxb3G3X9M3 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hmgxb3G3X9M3 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Hmgxb3G3X9M3 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Hmgxb3G3X9M3 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Hmgxb3G3X9M3 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Hmgxb3G3X9M3 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Hmgxb3G3X9M3 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Hmgxb3G3X9M3 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hmgxb3G3X9M3 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hmgxb3G3X9M3 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hmgxb3G3X9M3 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hmgxb3G3X9M3 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hmgxb3G3X9M3 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Hmgxb3G3X9M3 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms