Protein–RNA interactions for Protein: G3X9K3

Arfgef1, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgef1G3X9K3 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Arfgef1G3X9K3 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Arfgef1G3X9K3 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Arfgef1G3X9K3 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Arfgef1G3X9K3 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Arfgef1G3X9K3 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Arfgef1G3X9K3 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Arfgef1G3X9K3 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Arfgef1G3X9K3 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Arfgef1G3X9K3 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Arfgef1G3X9K3 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Arfgef1G3X9K3 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Arfgef1G3X9K3 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Arfgef1G3X9K3 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Arfgef1G3X9K3 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Arfgef1G3X9K3 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Arfgef1G3X9K3 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Arfgef1G3X9K3 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Arfgef1G3X9K3 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Arfgef1G3X9K3 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Arfgef1G3X9K3 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Arfgef1G3X9K3 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Arfgef1G3X9K3 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Arfgef1G3X9K3 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Arfgef1G3X9K3 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Arfgef1G3X9K3 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Arfgef1G3X9K3 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Arfgef1G3X9K3 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Arfgef1G3X9K3 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Arfgef1G3X9K3 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Arfgef1G3X9K3 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Arfgef1G3X9K3 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Arfgef1G3X9K3 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Arfgef1G3X9K3 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Arfgef1G3X9K3 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Arfgef1G3X9K3 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Arfgef1G3X9K3 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Arfgef1G3X9K3 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Arfgef1G3X9K3 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Arfgef1G3X9K3 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Arfgef1G3X9K3 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Arfgef1G3X9K3 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Arfgef1G3X9K3 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Arfgef1G3X9K3 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Arfgef1G3X9K3 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Arfgef1G3X9K3 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Arfgef1G3X9K3 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Arfgef1G3X9K3 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Arfgef1G3X9K3 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Arfgef1G3X9K3 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Arfgef1G3X9K3 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Arfgef1G3X9K3 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Arfgef1G3X9K3 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Arfgef1G3X9K3 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Arfgef1G3X9K3 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Arfgef1G3X9K3 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Arfgef1G3X9K3 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Arfgef1G3X9K3 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Arfgef1G3X9K3 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Arfgef1G3X9K3 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Arfgef1G3X9K3 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Arfgef1G3X9K3 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Arfgef1G3X9K3 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Arfgef1G3X9K3 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Arfgef1G3X9K3 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Arfgef1G3X9K3 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Arfgef1G3X9K3 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Arfgef1G3X9K3 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Arfgef1G3X9K3 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Arfgef1G3X9K3 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Arfgef1G3X9K3 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Arfgef1G3X9K3 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Arfgef1G3X9K3 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Arfgef1G3X9K3 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Arfgef1G3X9K3 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Arfgef1G3X9K3 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Arfgef1G3X9K3 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Arfgef1G3X9K3 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Arfgef1G3X9K3 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Arfgef1G3X9K3 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Arfgef1G3X9K3 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Arfgef1G3X9K3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Arfgef1G3X9K3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Arfgef1G3X9K3 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Arfgef1G3X9K3 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Arfgef1G3X9K3 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Arfgef1G3X9K3 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Arfgef1G3X9K3 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Arfgef1G3X9K3 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Arfgef1G3X9K3 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Arfgef1G3X9K3 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Arfgef1G3X9K3 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Arfgef1G3X9K3 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Arfgef1G3X9K3 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Arfgef1G3X9K3 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Arfgef1G3X9K3 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Arfgef1G3X9K3 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Arfgef1G3X9K3 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Arfgef1G3X9K3 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Arfgef1G3X9K3 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms