Protein–RNA interactions for Protein: G3X9F6

Sh3tc1, SH3 domain and tetratricopeptide repeats 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3tc1G3X9F6 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sh3tc1G3X9F6 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sh3tc1G3X9F6 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sh3tc1G3X9F6 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sh3tc1G3X9F6 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sh3tc1G3X9F6 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sh3tc1G3X9F6 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sh3tc1G3X9F6 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Sh3tc1G3X9F6 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sh3tc1G3X9F6 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sh3tc1G3X9F6 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sh3tc1G3X9F6 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sh3tc1G3X9F6 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sh3tc1G3X9F6 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sh3tc1G3X9F6 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sh3tc1G3X9F6 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sh3tc1G3X9F6 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sh3tc1G3X9F6 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sh3tc1G3X9F6 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sh3tc1G3X9F6 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sh3tc1G3X9F6 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sh3tc1G3X9F6 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sh3tc1G3X9F6 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sh3tc1G3X9F6 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sh3tc1G3X9F6 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sh3tc1G3X9F6 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sh3tc1G3X9F6 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sh3tc1G3X9F6 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sh3tc1G3X9F6 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sh3tc1G3X9F6 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sh3tc1G3X9F6 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sh3tc1G3X9F6 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sh3tc1G3X9F6 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sh3tc1G3X9F6 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sh3tc1G3X9F6 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sh3tc1G3X9F6 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sh3tc1G3X9F6 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sh3tc1G3X9F6 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sh3tc1G3X9F6 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sh3tc1G3X9F6 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sh3tc1G3X9F6 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sh3tc1G3X9F6 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sh3tc1G3X9F6 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sh3tc1G3X9F6 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sh3tc1G3X9F6 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sh3tc1G3X9F6 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sh3tc1G3X9F6 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sh3tc1G3X9F6 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sh3tc1G3X9F6 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sh3tc1G3X9F6 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sh3tc1G3X9F6 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sh3tc1G3X9F6 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sh3tc1G3X9F6 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sh3tc1G3X9F6 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sh3tc1G3X9F6 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sh3tc1G3X9F6 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sh3tc1G3X9F6 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sh3tc1G3X9F6 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sh3tc1G3X9F6 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sh3tc1G3X9F6 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sh3tc1G3X9F6 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sh3tc1G3X9F6 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sh3tc1G3X9F6 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sh3tc1G3X9F6 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Sh3tc1G3X9F6 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Sh3tc1G3X9F6 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Sh3tc1G3X9F6 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Sh3tc1G3X9F6 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Sh3tc1G3X9F6 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Sh3tc1G3X9F6 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Sh3tc1G3X9F6 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Sh3tc1G3X9F6 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Sh3tc1G3X9F6 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Sh3tc1G3X9F6 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sh3tc1G3X9F6 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sh3tc1G3X9F6 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sh3tc1G3X9F6 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sh3tc1G3X9F6 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sh3tc1G3X9F6 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sh3tc1G3X9F6 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sh3tc1G3X9F6 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sh3tc1G3X9F6 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sh3tc1G3X9F6 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sh3tc1G3X9F6 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sh3tc1G3X9F6 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sh3tc1G3X9F6 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sh3tc1G3X9F6 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sh3tc1G3X9F6 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sh3tc1G3X9F6 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sh3tc1G3X9F6 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sh3tc1G3X9F6 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sh3tc1G3X9F6 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sh3tc1G3X9F6 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sh3tc1G3X9F6 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sh3tc1G3X9F6 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Sh3tc1G3X9F6 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sh3tc1G3X9F6 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sh3tc1G3X9F6 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sh3tc1G3X9F6 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sh3tc1G3X9F6 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms