Protein–RNA interactions for Protein: G3X8R9

Tmigd3, Transmembrane domain-containing protein TMIGD3, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmigd3G3X8R9 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tmigd3G3X8R9 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tmigd3G3X8R9 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tmigd3G3X8R9 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmigd3G3X8R9 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmigd3G3X8R9 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmigd3G3X8R9 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmigd3G3X8R9 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmigd3G3X8R9 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmigd3G3X8R9 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmigd3G3X8R9 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmigd3G3X8R9 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmigd3G3X8R9 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmigd3G3X8R9 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmigd3G3X8R9 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmigd3G3X8R9 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmigd3G3X8R9 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmigd3G3X8R9 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmigd3G3X8R9 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmigd3G3X8R9 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmigd3G3X8R9 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tmigd3G3X8R9 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tmigd3G3X8R9 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tmigd3G3X8R9 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tmigd3G3X8R9 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tmigd3G3X8R9 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tmigd3G3X8R9 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Tmigd3G3X8R9 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Tmigd3G3X8R9 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Tmigd3G3X8R9 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tmigd3G3X8R9 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tmigd3G3X8R9 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tmigd3G3X8R9 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tmigd3G3X8R9 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tmigd3G3X8R9 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tmigd3G3X8R9 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tmigd3G3X8R9 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tmigd3G3X8R9 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tmigd3G3X8R9 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tmigd3G3X8R9 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tmigd3G3X8R9 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tmigd3G3X8R9 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tmigd3G3X8R9 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tmigd3G3X8R9 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tmigd3G3X8R9 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tmigd3G3X8R9 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tmigd3G3X8R9 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tmigd3G3X8R9 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tmigd3G3X8R9 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tmigd3G3X8R9 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tmigd3G3X8R9 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Tmigd3G3X8R9 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tmigd3G3X8R9 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tmigd3G3X8R9 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tmigd3G3X8R9 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tmigd3G3X8R9 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tmigd3G3X8R9 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tmigd3G3X8R9 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tmigd3G3X8R9 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tmigd3G3X8R9 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Tmigd3G3X8R9 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tmigd3G3X8R9 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Tmigd3G3X8R9 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tmigd3G3X8R9 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tmigd3G3X8R9 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Tmigd3G3X8R9 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tmigd3G3X8R9 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tmigd3G3X8R9 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tmigd3G3X8R9 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tmigd3G3X8R9 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tmigd3G3X8R9 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tmigd3G3X8R9 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tmigd3G3X8R9 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Tmigd3G3X8R9 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tmigd3G3X8R9 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Tmigd3G3X8R9 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tmigd3G3X8R9 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tmigd3G3X8R9 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tmigd3G3X8R9 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tmigd3G3X8R9 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tmigd3G3X8R9 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tmigd3G3X8R9 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tmigd3G3X8R9 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tmigd3G3X8R9 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tmigd3G3X8R9 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tmigd3G3X8R9 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tmigd3G3X8R9 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tmigd3G3X8R9 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tmigd3G3X8R9 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tmigd3G3X8R9 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tmigd3G3X8R9 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tmigd3G3X8R9 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tmigd3G3X8R9 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tmigd3G3X8R9 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tmigd3G3X8R9 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tmigd3G3X8R9 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tmigd3G3X8R9 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tmigd3G3X8R9 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tmigd3G3X8R9 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tmigd3G3X8R9 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms