Protein–RNA interactions for Protein: F8VQB8

Npcd, Neuronal pentraxin chromo domain, mousemouse

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Length 469 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NpcdF8VQB8 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NpcdF8VQB8 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NpcdF8VQB8 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NpcdF8VQB8 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NpcdF8VQB8 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NpcdF8VQB8 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
NpcdF8VQB8 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NpcdF8VQB8 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NpcdF8VQB8 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NpcdF8VQB8 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NpcdF8VQB8 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NpcdF8VQB8 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NpcdF8VQB8 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NpcdF8VQB8 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NpcdF8VQB8 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NpcdF8VQB8 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NpcdF8VQB8 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NpcdF8VQB8 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
NpcdF8VQB8 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NpcdF8VQB8 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NpcdF8VQB8 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
NpcdF8VQB8 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NpcdF8VQB8 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NpcdF8VQB8 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NpcdF8VQB8 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NpcdF8VQB8 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NpcdF8VQB8 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NpcdF8VQB8 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NpcdF8VQB8 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NpcdF8VQB8 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NpcdF8VQB8 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NpcdF8VQB8 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NpcdF8VQB8 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NpcdF8VQB8 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NpcdF8VQB8 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NpcdF8VQB8 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NpcdF8VQB8 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NpcdF8VQB8 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NpcdF8VQB8 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NpcdF8VQB8 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NpcdF8VQB8 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NpcdF8VQB8 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NpcdF8VQB8 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NpcdF8VQB8 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NpcdF8VQB8 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NpcdF8VQB8 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NpcdF8VQB8 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NpcdF8VQB8 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NpcdF8VQB8 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NpcdF8VQB8 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NpcdF8VQB8 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NpcdF8VQB8 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NpcdF8VQB8 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NpcdF8VQB8 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NpcdF8VQB8 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NpcdF8VQB8 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NpcdF8VQB8 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NpcdF8VQB8 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NpcdF8VQB8 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NpcdF8VQB8 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NpcdF8VQB8 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NpcdF8VQB8 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NpcdF8VQB8 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NpcdF8VQB8 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NpcdF8VQB8 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NpcdF8VQB8 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NpcdF8VQB8 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NpcdF8VQB8 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NpcdF8VQB8 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NpcdF8VQB8 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NpcdF8VQB8 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
NpcdF8VQB8 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NpcdF8VQB8 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NpcdF8VQB8 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NpcdF8VQB8 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NpcdF8VQB8 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NpcdF8VQB8 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NpcdF8VQB8 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NpcdF8VQB8 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NpcdF8VQB8 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
NpcdF8VQB8 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NpcdF8VQB8 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NpcdF8VQB8 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NpcdF8VQB8 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NpcdF8VQB8 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NpcdF8VQB8 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NpcdF8VQB8 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NpcdF8VQB8 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NpcdF8VQB8 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NpcdF8VQB8 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NpcdF8VQB8 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NpcdF8VQB8 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NpcdF8VQB8 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NpcdF8VQB8 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NpcdF8VQB8 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NpcdF8VQB8 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NpcdF8VQB8 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NpcdF8VQB8 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NpcdF8VQB8 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NpcdF8VQB8 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
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