Protein–RNA interactions for Protein: F8VPZ9

Bicra, BRD4-interacting chromatin-remodeling complex-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BicraF8VPZ9 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
BicraF8VPZ9 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
BicraF8VPZ9 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
BicraF8VPZ9 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
BicraF8VPZ9 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
BicraF8VPZ9 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC33.2■■■□□ 2.91
BicraF8VPZ9 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.9
BicraF8VPZ9 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
BicraF8VPZ9 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
BicraF8VPZ9 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
BicraF8VPZ9 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
BicraF8VPZ9 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
BicraF8VPZ9 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
BicraF8VPZ9 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
BicraF8VPZ9 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
BicraF8VPZ9 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
BicraF8VPZ9 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
BicraF8VPZ9 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
BicraF8VPZ9 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
BicraF8VPZ9 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
BicraF8VPZ9 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC33.17■■■□□ 2.9
BicraF8VPZ9 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
BicraF8VPZ9 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
BicraF8VPZ9 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
BicraF8VPZ9 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
BicraF8VPZ9 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
BicraF8VPZ9 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC33.16■■■□□ 2.9
BicraF8VPZ9 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
BicraF8VPZ9 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
BicraF8VPZ9 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC33.16■■■□□ 2.9
BicraF8VPZ9 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
BicraF8VPZ9 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
BicraF8VPZ9 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
BicraF8VPZ9 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
BicraF8VPZ9 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
BicraF8VPZ9 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
BicraF8VPZ9 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
BicraF8VPZ9 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
BicraF8VPZ9 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
BicraF8VPZ9 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
BicraF8VPZ9 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
BicraF8VPZ9 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
BicraF8VPZ9 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
BicraF8VPZ9 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
BicraF8VPZ9 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
BicraF8VPZ9 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
BicraF8VPZ9 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
BicraF8VPZ9 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
BicraF8VPZ9 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
BicraF8VPZ9 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
BicraF8VPZ9 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
BicraF8VPZ9 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
BicraF8VPZ9 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
BicraF8VPZ9 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
BicraF8VPZ9 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC33.12■■■□□ 2.89
BicraF8VPZ9 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
BicraF8VPZ9 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
BicraF8VPZ9 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
BicraF8VPZ9 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
BicraF8VPZ9 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
BicraF8VPZ9 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
BicraF8VPZ9 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
BicraF8VPZ9 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
BicraF8VPZ9 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC33.11■■■□□ 2.89
BicraF8VPZ9 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
BicraF8VPZ9 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
BicraF8VPZ9 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC33.11■■■□□ 2.89
BicraF8VPZ9 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
BicraF8VPZ9 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC33.11■■■□□ 2.89
BicraF8VPZ9 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC33.11■■■□□ 2.89
BicraF8VPZ9 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
BicraF8VPZ9 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.1■■■□□ 2.89
BicraF8VPZ9 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
BicraF8VPZ9 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
BicraF8VPZ9 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
BicraF8VPZ9 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
BicraF8VPZ9 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
BicraF8VPZ9 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
BicraF8VPZ9 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
BicraF8VPZ9 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
BicraF8VPZ9 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
BicraF8VPZ9 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
BicraF8VPZ9 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
BicraF8VPZ9 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
BicraF8VPZ9 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
BicraF8VPZ9 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC33.09■■■□□ 2.89
BicraF8VPZ9 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
BicraF8VPZ9 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
BicraF8VPZ9 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
BicraF8VPZ9 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
BicraF8VPZ9 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
BicraF8VPZ9 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
BicraF8VPZ9 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
BicraF8VPZ9 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
BicraF8VPZ9 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
BicraF8VPZ9 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
BicraF8VPZ9 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
BicraF8VPZ9 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC33.07■■■□□ 2.88
BicraF8VPZ9 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
BicraF8VPZ9 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms