Protein–RNA interactions for Protein: F8VPZ5

Ercc6, Excision repair cross-complementing rodent repair deficiency, complementation group 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc6F8VPZ5 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Ercc6F8VPZ5 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC31.54■■■□□ 2.64
Ercc6F8VPZ5 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC31.53■■■□□ 2.64
Ercc6F8VPZ5 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Ercc6F8VPZ5 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC31.53■■■□□ 2.64
Ercc6F8VPZ5 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC31.53■■■□□ 2.64
Ercc6F8VPZ5 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Ercc6F8VPZ5 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
Ercc6F8VPZ5 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Ercc6F8VPZ5 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Ercc6F8VPZ5 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Ercc6F8VPZ5 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Ercc6F8VPZ5 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Ercc6F8VPZ5 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Ercc6F8VPZ5 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Ercc6F8VPZ5 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Ercc6F8VPZ5 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC31.52■■■□□ 2.64
Ercc6F8VPZ5 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Ercc6F8VPZ5 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC31.52■■■□□ 2.64
Ercc6F8VPZ5 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
Ercc6F8VPZ5 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Ercc6F8VPZ5 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC31.51■■■□□ 2.64
Ercc6F8VPZ5 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
Ercc6F8VPZ5 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
Ercc6F8VPZ5 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.63
Ercc6F8VPZ5 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
Ercc6F8VPZ5 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.63
Ercc6F8VPZ5 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC31.51■■■□□ 2.63
Ercc6F8VPZ5 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC31.51■■■□□ 2.63
Ercc6F8VPZ5 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Ercc6F8VPZ5 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
Ercc6F8VPZ5 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Ercc6F8VPZ5 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Ercc6F8VPZ5 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Ercc6F8VPZ5 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Ercc6F8VPZ5 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
Ercc6F8VPZ5 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC31.5■■■□□ 2.63
Ercc6F8VPZ5 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Ercc6F8VPZ5 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Ercc6F8VPZ5 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
Ercc6F8VPZ5 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Ercc6F8VPZ5 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Ercc6F8VPZ5 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Ercc6F8VPZ5 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Ercc6F8VPZ5 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Ercc6F8VPZ5 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Ercc6F8VPZ5 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Ercc6F8VPZ5 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
Ercc6F8VPZ5 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC31.48■■■□□ 2.63
Ercc6F8VPZ5 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
Ercc6F8VPZ5 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Ercc6F8VPZ5 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
Ercc6F8VPZ5 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
Ercc6F8VPZ5 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC31.47■■■□□ 2.63
Ercc6F8VPZ5 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC31.47■■■□□ 2.63
Ercc6F8VPZ5 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Ercc6F8VPZ5 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
Ercc6F8VPZ5 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Ercc6F8VPZ5 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Ercc6F8VPZ5 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC31.46■■■□□ 2.63
Ercc6F8VPZ5 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
Ercc6F8VPZ5 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Ercc6F8VPZ5 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Ercc6F8VPZ5 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Ercc6F8VPZ5 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
Ercc6F8VPZ5 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
Ercc6F8VPZ5 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
Ercc6F8VPZ5 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
Ercc6F8VPZ5 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
Ercc6F8VPZ5 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
Ercc6F8VPZ5 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC31.45■■■□□ 2.62
Ercc6F8VPZ5 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC31.45■■■□□ 2.62
Ercc6F8VPZ5 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
Ercc6F8VPZ5 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Ercc6F8VPZ5 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Ercc6F8VPZ5 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Ercc6F8VPZ5 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
Ercc6F8VPZ5 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
Ercc6F8VPZ5 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
Ercc6F8VPZ5 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC31.43■■■□□ 2.62
Ercc6F8VPZ5 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Ercc6F8VPZ5 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
Ercc6F8VPZ5 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
Ercc6F8VPZ5 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Ercc6F8VPZ5 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC31.42■■■□□ 2.62
Ercc6F8VPZ5 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Ercc6F8VPZ5 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Ercc6F8VPZ5 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
Ercc6F8VPZ5 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Ercc6F8VPZ5 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Ercc6F8VPZ5 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Ercc6F8VPZ5 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Ercc6F8VPZ5 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Ercc6F8VPZ5 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Ercc6F8VPZ5 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Ercc6F8VPZ5 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Ercc6F8VPZ5 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Ercc6F8VPZ5 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Ercc6F8VPZ5 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Ercc6F8VPZ5 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms