Protein–RNA interactions for Protein: F8VPK0

Ttc37, Tetratricopeptide repeat domain 37, mousemouse

Predictions only

Length 1,563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc37F8VPK0 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ttc37F8VPK0 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ttc37F8VPK0 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ttc37F8VPK0 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ttc37F8VPK0 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ttc37F8VPK0 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ttc37F8VPK0 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ttc37F8VPK0 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ttc37F8VPK0 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ttc37F8VPK0 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ttc37F8VPK0 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Ttc37F8VPK0 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ttc37F8VPK0 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ttc37F8VPK0 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ttc37F8VPK0 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ttc37F8VPK0 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ttc37F8VPK0 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ttc37F8VPK0 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ttc37F8VPK0 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ttc37F8VPK0 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ttc37F8VPK0 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ttc37F8VPK0 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ttc37F8VPK0 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ttc37F8VPK0 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ttc37F8VPK0 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ttc37F8VPK0 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ttc37F8VPK0 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ttc37F8VPK0 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ttc37F8VPK0 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Ttc37F8VPK0 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Ttc37F8VPK0 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Ttc37F8VPK0 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Ttc37F8VPK0 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ttc37F8VPK0 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ttc37F8VPK0 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ttc37F8VPK0 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ttc37F8VPK0 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ttc37F8VPK0 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ttc37F8VPK0 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ttc37F8VPK0 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ttc37F8VPK0 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ttc37F8VPK0 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ttc37F8VPK0 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Ttc37F8VPK0 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ttc37F8VPK0 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ttc37F8VPK0 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ttc37F8VPK0 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ttc37F8VPK0 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ttc37F8VPK0 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Ttc37F8VPK0 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Ttc37F8VPK0 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Ttc37F8VPK0 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ttc37F8VPK0 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ttc37F8VPK0 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Ttc37F8VPK0 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ttc37F8VPK0 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ttc37F8VPK0 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ttc37F8VPK0 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ttc37F8VPK0 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ttc37F8VPK0 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ttc37F8VPK0 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ttc37F8VPK0 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ttc37F8VPK0 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ttc37F8VPK0 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ttc37F8VPK0 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ttc37F8VPK0 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ttc37F8VPK0 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ttc37F8VPK0 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ttc37F8VPK0 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ttc37F8VPK0 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ttc37F8VPK0 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ttc37F8VPK0 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ttc37F8VPK0 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ttc37F8VPK0 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ttc37F8VPK0 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ttc37F8VPK0 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ttc37F8VPK0 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Ttc37F8VPK0 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Ttc37F8VPK0 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ttc37F8VPK0 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ttc37F8VPK0 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ttc37F8VPK0 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ttc37F8VPK0 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Ttc37F8VPK0 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Ttc37F8VPK0 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Ttc37F8VPK0 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Ttc37F8VPK0 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Ttc37F8VPK0 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ttc37F8VPK0 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ttc37F8VPK0 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ttc37F8VPK0 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ttc37F8VPK0 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Ttc37F8VPK0 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ttc37F8VPK0 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ttc37F8VPK0 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ttc37F8VPK0 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ttc37F8VPK0 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ttc37F8VPK0 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ttc37F8VPK0 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ttc37F8VPK0 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms