Protein–RNA interactions for Protein: F7CXU4

H2-M1, Histocompatibility 2, M region locus 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M1F7CXU4 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2-M1F7CXU4 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2-M1F7CXU4 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H2-M1F7CXU4 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2-M1F7CXU4 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2-M1F7CXU4 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2-M1F7CXU4 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2-M1F7CXU4 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2-M1F7CXU4 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2-M1F7CXU4 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2-M1F7CXU4 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2-M1F7CXU4 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2-M1F7CXU4 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
H2-M1F7CXU4 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2-M1F7CXU4 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2-M1F7CXU4 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2-M1F7CXU4 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H2-M1F7CXU4 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2-M1F7CXU4 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2-M1F7CXU4 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2-M1F7CXU4 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2-M1F7CXU4 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2-M1F7CXU4 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2-M1F7CXU4 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
H2-M1F7CXU4 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2-M1F7CXU4 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
H2-M1F7CXU4 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2-M1F7CXU4 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
H2-M1F7CXU4 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2-M1F7CXU4 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2-M1F7CXU4 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2-M1F7CXU4 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
H2-M1F7CXU4 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2-M1F7CXU4 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2-M1F7CXU4 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2-M1F7CXU4 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2-M1F7CXU4 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2-M1F7CXU4 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H2-M1F7CXU4 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
H2-M1F7CXU4 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
H2-M1F7CXU4 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
H2-M1F7CXU4 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
H2-M1F7CXU4 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
H2-M1F7CXU4 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
H2-M1F7CXU4 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
H2-M1F7CXU4 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
H2-M1F7CXU4 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
H2-M1F7CXU4 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
H2-M1F7CXU4 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
H2-M1F7CXU4 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
H2-M1F7CXU4 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
H2-M1F7CXU4 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
H2-M1F7CXU4 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
H2-M1F7CXU4 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
H2-M1F7CXU4 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
H2-M1F7CXU4 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
H2-M1F7CXU4 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
H2-M1F7CXU4 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
H2-M1F7CXU4 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
H2-M1F7CXU4 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
H2-M1F7CXU4 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
H2-M1F7CXU4 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
H2-M1F7CXU4 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
H2-M1F7CXU4 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
H2-M1F7CXU4 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
H2-M1F7CXU4 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
H2-M1F7CXU4 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
H2-M1F7CXU4 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
H2-M1F7CXU4 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
H2-M1F7CXU4 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
H2-M1F7CXU4 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
H2-M1F7CXU4 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
H2-M1F7CXU4 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
H2-M1F7CXU4 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
H2-M1F7CXU4 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
H2-M1F7CXU4 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
H2-M1F7CXU4 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
H2-M1F7CXU4 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
H2-M1F7CXU4 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
H2-M1F7CXU4 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
H2-M1F7CXU4 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
H2-M1F7CXU4 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
H2-M1F7CXU4 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
H2-M1F7CXU4 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
H2-M1F7CXU4 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
H2-M1F7CXU4 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
H2-M1F7CXU4 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
H2-M1F7CXU4 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2-M1F7CXU4 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2-M1F7CXU4 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2-M1F7CXU4 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2-M1F7CXU4 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2-M1F7CXU4 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2-M1F7CXU4 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2-M1F7CXU4 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
H2-M1F7CXU4 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2-M1F7CXU4 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2-M1F7CXU4 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
H2-M1F7CXU4 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
H2-M1F7CXU4 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.6 ms