Protein–RNA interactions for Protein: F7BY56

Gm8138, Predicted gene 8138 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8138F7BY56 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm8138F7BY56 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm8138F7BY56 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm8138F7BY56 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm8138F7BY56 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm8138F7BY56 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm8138F7BY56 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm8138F7BY56 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm8138F7BY56 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm8138F7BY56 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm8138F7BY56 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm8138F7BY56 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm8138F7BY56 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm8138F7BY56 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm8138F7BY56 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm8138F7BY56 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm8138F7BY56 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm8138F7BY56 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm8138F7BY56 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm8138F7BY56 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm8138F7BY56 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm8138F7BY56 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm8138F7BY56 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm8138F7BY56 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm8138F7BY56 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm8138F7BY56 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm8138F7BY56 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm8138F7BY56 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm8138F7BY56 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm8138F7BY56 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm8138F7BY56 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm8138F7BY56 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm8138F7BY56 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm8138F7BY56 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm8138F7BY56 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm8138F7BY56 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm8138F7BY56 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm8138F7BY56 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm8138F7BY56 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm8138F7BY56 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm8138F7BY56 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm8138F7BY56 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm8138F7BY56 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm8138F7BY56 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm8138F7BY56 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm8138F7BY56 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm8138F7BY56 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm8138F7BY56 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm8138F7BY56 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm8138F7BY56 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm8138F7BY56 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gm8138F7BY56 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gm8138F7BY56 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm8138F7BY56 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm8138F7BY56 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm8138F7BY56 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm8138F7BY56 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm8138F7BY56 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm8138F7BY56 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm8138F7BY56 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm8138F7BY56 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm8138F7BY56 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm8138F7BY56 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm8138F7BY56 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm8138F7BY56 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm8138F7BY56 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm8138F7BY56 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm8138F7BY56 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm8138F7BY56 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm8138F7BY56 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm8138F7BY56 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm8138F7BY56 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm8138F7BY56 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm8138F7BY56 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm8138F7BY56 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm8138F7BY56 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm8138F7BY56 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm8138F7BY56 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm8138F7BY56 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm8138F7BY56 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm8138F7BY56 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm8138F7BY56 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm8138F7BY56 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm8138F7BY56 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm8138F7BY56 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm8138F7BY56 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm8138F7BY56 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm8138F7BY56 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm8138F7BY56 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm8138F7BY56 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm8138F7BY56 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm8138F7BY56 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm8138F7BY56 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm8138F7BY56 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm8138F7BY56 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm8138F7BY56 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm8138F7BY56 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm8138F7BY56 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm8138F7BY56 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm8138F7BY56 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms