Protein–RNA interactions for Protein: F6ZIS7

Rarres1, Retinoic acid receptor responder (tazarotene-induced) 1, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rarres1F6ZIS7 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rarres1F6ZIS7 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rarres1F6ZIS7 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rarres1F6ZIS7 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rarres1F6ZIS7 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rarres1F6ZIS7 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rarres1F6ZIS7 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rarres1F6ZIS7 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rarres1F6ZIS7 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rarres1F6ZIS7 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rarres1F6ZIS7 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rarres1F6ZIS7 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rarres1F6ZIS7 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rarres1F6ZIS7 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rarres1F6ZIS7 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rarres1F6ZIS7 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rarres1F6ZIS7 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rarres1F6ZIS7 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rarres1F6ZIS7 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rarres1F6ZIS7 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rarres1F6ZIS7 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Rarres1F6ZIS7 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rarres1F6ZIS7 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rarres1F6ZIS7 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rarres1F6ZIS7 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rarres1F6ZIS7 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rarres1F6ZIS7 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rarres1F6ZIS7 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rarres1F6ZIS7 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Rarres1F6ZIS7 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rarres1F6ZIS7 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rarres1F6ZIS7 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rarres1F6ZIS7 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rarres1F6ZIS7 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rarres1F6ZIS7 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rarres1F6ZIS7 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rarres1F6ZIS7 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rarres1F6ZIS7 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rarres1F6ZIS7 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rarres1F6ZIS7 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rarres1F6ZIS7 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rarres1F6ZIS7 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rarres1F6ZIS7 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rarres1F6ZIS7 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rarres1F6ZIS7 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rarres1F6ZIS7 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rarres1F6ZIS7 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rarres1F6ZIS7 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rarres1F6ZIS7 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rarres1F6ZIS7 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rarres1F6ZIS7 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rarres1F6ZIS7 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rarres1F6ZIS7 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rarres1F6ZIS7 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rarres1F6ZIS7 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rarres1F6ZIS7 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rarres1F6ZIS7 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rarres1F6ZIS7 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rarres1F6ZIS7 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rarres1F6ZIS7 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rarres1F6ZIS7 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rarres1F6ZIS7 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rarres1F6ZIS7 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rarres1F6ZIS7 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rarres1F6ZIS7 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rarres1F6ZIS7 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rarres1F6ZIS7 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rarres1F6ZIS7 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rarres1F6ZIS7 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rarres1F6ZIS7 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rarres1F6ZIS7 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rarres1F6ZIS7 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rarres1F6ZIS7 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rarres1F6ZIS7 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rarres1F6ZIS7 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rarres1F6ZIS7 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rarres1F6ZIS7 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rarres1F6ZIS7 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rarres1F6ZIS7 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rarres1F6ZIS7 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rarres1F6ZIS7 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rarres1F6ZIS7 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rarres1F6ZIS7 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rarres1F6ZIS7 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rarres1F6ZIS7 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rarres1F6ZIS7 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rarres1F6ZIS7 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rarres1F6ZIS7 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rarres1F6ZIS7 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rarres1F6ZIS7 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rarres1F6ZIS7 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rarres1F6ZIS7 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rarres1F6ZIS7 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rarres1F6ZIS7 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rarres1F6ZIS7 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rarres1F6ZIS7 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rarres1F6ZIS7 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rarres1F6ZIS7 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rarres1F6ZIS7 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rarres1F6ZIS7 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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