Protein–RNA interactions for Protein: F6ZGR6

D430041D05Rik, RIKEN cDNA D430041D05 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D430041D05RikF6ZGR6 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
D430041D05RikF6ZGR6 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
D430041D05RikF6ZGR6 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
D430041D05RikF6ZGR6 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
D430041D05RikF6ZGR6 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
D430041D05RikF6ZGR6 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
D430041D05RikF6ZGR6 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
D430041D05RikF6ZGR6 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
D430041D05RikF6ZGR6 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
D430041D05RikF6ZGR6 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
D430041D05RikF6ZGR6 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
D430041D05RikF6ZGR6 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
D430041D05RikF6ZGR6 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
D430041D05RikF6ZGR6 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
D430041D05RikF6ZGR6 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
D430041D05RikF6ZGR6 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
D430041D05RikF6ZGR6 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
D430041D05RikF6ZGR6 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
D430041D05RikF6ZGR6 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
D430041D05RikF6ZGR6 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
D430041D05RikF6ZGR6 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
D430041D05RikF6ZGR6 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
D430041D05RikF6ZGR6 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
D430041D05RikF6ZGR6 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
D430041D05RikF6ZGR6 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
D430041D05RikF6ZGR6 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
D430041D05RikF6ZGR6 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
D430041D05RikF6ZGR6 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
D430041D05RikF6ZGR6 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
D430041D05RikF6ZGR6 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
D430041D05RikF6ZGR6 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
D430041D05RikF6ZGR6 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
D430041D05RikF6ZGR6 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
D430041D05RikF6ZGR6 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
D430041D05RikF6ZGR6 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
D430041D05RikF6ZGR6 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
D430041D05RikF6ZGR6 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
D430041D05RikF6ZGR6 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
D430041D05RikF6ZGR6 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
D430041D05RikF6ZGR6 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
D430041D05RikF6ZGR6 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
D430041D05RikF6ZGR6 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
D430041D05RikF6ZGR6 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
D430041D05RikF6ZGR6 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
D430041D05RikF6ZGR6 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
D430041D05RikF6ZGR6 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
D430041D05RikF6ZGR6 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
D430041D05RikF6ZGR6 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
D430041D05RikF6ZGR6 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
D430041D05RikF6ZGR6 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
D430041D05RikF6ZGR6 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
D430041D05RikF6ZGR6 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
D430041D05RikF6ZGR6 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
D430041D05RikF6ZGR6 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
D430041D05RikF6ZGR6 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
D430041D05RikF6ZGR6 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
D430041D05RikF6ZGR6 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
D430041D05RikF6ZGR6 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
D430041D05RikF6ZGR6 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
D430041D05RikF6ZGR6 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
D430041D05RikF6ZGR6 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
D430041D05RikF6ZGR6 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
D430041D05RikF6ZGR6 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
D430041D05RikF6ZGR6 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
D430041D05RikF6ZGR6 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
D430041D05RikF6ZGR6 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
D430041D05RikF6ZGR6 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
D430041D05RikF6ZGR6 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
D430041D05RikF6ZGR6 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
D430041D05RikF6ZGR6 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
D430041D05RikF6ZGR6 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
D430041D05RikF6ZGR6 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
D430041D05RikF6ZGR6 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
D430041D05RikF6ZGR6 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
D430041D05RikF6ZGR6 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
D430041D05RikF6ZGR6 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
D430041D05RikF6ZGR6 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
D430041D05RikF6ZGR6 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
D430041D05RikF6ZGR6 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
D430041D05RikF6ZGR6 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
D430041D05RikF6ZGR6 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
D430041D05RikF6ZGR6 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
D430041D05RikF6ZGR6 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
D430041D05RikF6ZGR6 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
D430041D05RikF6ZGR6 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
D430041D05RikF6ZGR6 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
D430041D05RikF6ZGR6 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
D430041D05RikF6ZGR6 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
D430041D05RikF6ZGR6 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
D430041D05RikF6ZGR6 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
D430041D05RikF6ZGR6 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
D430041D05RikF6ZGR6 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
D430041D05RikF6ZGR6 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
D430041D05RikF6ZGR6 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
D430041D05RikF6ZGR6 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
D430041D05RikF6ZGR6 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
D430041D05RikF6ZGR6 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
D430041D05RikF6ZGR6 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
D430041D05RikF6ZGR6 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
D430041D05RikF6ZGR6 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms