Protein–RNA interactions for Protein: F6YKY3

Gm8005, Predicted gene 8005 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8005F6YKY3 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Gm8005F6YKY3 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm8005F6YKY3 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm8005F6YKY3 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm8005F6YKY3 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm8005F6YKY3 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm8005F6YKY3 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm8005F6YKY3 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm8005F6YKY3 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm8005F6YKY3 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm8005F6YKY3 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm8005F6YKY3 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm8005F6YKY3 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm8005F6YKY3 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm8005F6YKY3 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm8005F6YKY3 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm8005F6YKY3 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm8005F6YKY3 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm8005F6YKY3 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm8005F6YKY3 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm8005F6YKY3 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
Gm8005F6YKY3 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm8005F6YKY3 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm8005F6YKY3 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm8005F6YKY3 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm8005F6YKY3 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm8005F6YKY3 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm8005F6YKY3 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm8005F6YKY3 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm8005F6YKY3 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm8005F6YKY3 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm8005F6YKY3 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm8005F6YKY3 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm8005F6YKY3 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm8005F6YKY3 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm8005F6YKY3 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm8005F6YKY3 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm8005F6YKY3 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm8005F6YKY3 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm8005F6YKY3 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm8005F6YKY3 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm8005F6YKY3 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm8005F6YKY3 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm8005F6YKY3 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm8005F6YKY3 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm8005F6YKY3 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm8005F6YKY3 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm8005F6YKY3 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm8005F6YKY3 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm8005F6YKY3 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm8005F6YKY3 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm8005F6YKY3 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm8005F6YKY3 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm8005F6YKY3 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
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Gm8005F6YKY3 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm8005F6YKY3 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm8005F6YKY3 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm8005F6YKY3 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm8005F6YKY3 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm8005F6YKY3 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm8005F6YKY3 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm8005F6YKY3 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Gm8005F6YKY3 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm8005F6YKY3 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm8005F6YKY3 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm8005F6YKY3 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm8005F6YKY3 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm8005F6YKY3 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm8005F6YKY3 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm8005F6YKY3 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm8005F6YKY3 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm8005F6YKY3 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm8005F6YKY3 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm8005F6YKY3 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm8005F6YKY3 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm8005F6YKY3 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm8005F6YKY3 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm8005F6YKY3 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm8005F6YKY3 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm8005F6YKY3 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm8005F6YKY3 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm8005F6YKY3 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm8005F6YKY3 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm8005F6YKY3 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm8005F6YKY3 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm8005F6YKY3 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm8005F6YKY3 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm8005F6YKY3 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm8005F6YKY3 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm8005F6YKY3 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm8005F6YKY3 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm8005F6YKY3 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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