Protein–RNA interactions for Protein: F6XLV1

Crocc2, Ciliary rootlet coiled-coil, rootletin family member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crocc2F6XLV1 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Crocc2F6XLV1 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Crocc2F6XLV1 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
Crocc2F6XLV1 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Crocc2F6XLV1 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Crocc2F6XLV1 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Crocc2F6XLV1 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Crocc2F6XLV1 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Crocc2F6XLV1 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Crocc2F6XLV1 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Crocc2F6XLV1 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Crocc2F6XLV1 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Crocc2F6XLV1 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
Crocc2F6XLV1 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Crocc2F6XLV1 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Crocc2F6XLV1 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Crocc2F6XLV1 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Crocc2F6XLV1 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Crocc2F6XLV1 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Crocc2F6XLV1 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Crocc2F6XLV1 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Crocc2F6XLV1 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Crocc2F6XLV1 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Crocc2F6XLV1 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Crocc2F6XLV1 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Crocc2F6XLV1 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Crocc2F6XLV1 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Crocc2F6XLV1 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Crocc2F6XLV1 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
Crocc2F6XLV1 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Crocc2F6XLV1 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Crocc2F6XLV1 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC29.45■■■□□ 2.3
Crocc2F6XLV1 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Crocc2F6XLV1 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Crocc2F6XLV1 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Crocc2F6XLV1 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Crocc2F6XLV1 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Crocc2F6XLV1 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Crocc2F6XLV1 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
Crocc2F6XLV1 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Crocc2F6XLV1 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Crocc2F6XLV1 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Crocc2F6XLV1 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Crocc2F6XLV1 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Crocc2F6XLV1 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Crocc2F6XLV1 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Crocc2F6XLV1 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Crocc2F6XLV1 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Crocc2F6XLV1 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Crocc2F6XLV1 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Crocc2F6XLV1 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Crocc2F6XLV1 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Crocc2F6XLV1 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Crocc2F6XLV1 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Crocc2F6XLV1 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Crocc2F6XLV1 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Crocc2F6XLV1 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Crocc2F6XLV1 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Crocc2F6XLV1 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Crocc2F6XLV1 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Crocc2F6XLV1 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Crocc2F6XLV1 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Crocc2F6XLV1 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Crocc2F6XLV1 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Crocc2F6XLV1 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Crocc2F6XLV1 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Crocc2F6XLV1 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Crocc2F6XLV1 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Crocc2F6XLV1 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Crocc2F6XLV1 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Crocc2F6XLV1 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC29.39■■■□□ 2.29
Crocc2F6XLV1 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Crocc2F6XLV1 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
Crocc2F6XLV1 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Crocc2F6XLV1 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Crocc2F6XLV1 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Crocc2F6XLV1 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Crocc2F6XLV1 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
Crocc2F6XLV1 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Crocc2F6XLV1 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Crocc2F6XLV1 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Crocc2F6XLV1 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Crocc2F6XLV1 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Crocc2F6XLV1 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Crocc2F6XLV1 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Crocc2F6XLV1 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Crocc2F6XLV1 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Crocc2F6XLV1 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
Crocc2F6XLV1 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Crocc2F6XLV1 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
Crocc2F6XLV1 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Crocc2F6XLV1 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Crocc2F6XLV1 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Crocc2F6XLV1 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Crocc2F6XLV1 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Crocc2F6XLV1 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
Crocc2F6XLV1 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Crocc2F6XLV1 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Crocc2F6XLV1 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
Crocc2F6XLV1 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms