Protein–RNA interactions for Protein: F2Z3U3

Raph1, Ras association (RalGDS/AF-6) and pleckstrin homology domains 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Raph1F2Z3U3 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Raph1F2Z3U3 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Raph1F2Z3U3 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Raph1F2Z3U3 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Raph1F2Z3U3 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Raph1F2Z3U3 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Raph1F2Z3U3 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Raph1F2Z3U3 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Raph1F2Z3U3 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Raph1F2Z3U3 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Raph1F2Z3U3 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Raph1F2Z3U3 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Raph1F2Z3U3 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Raph1F2Z3U3 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Raph1F2Z3U3 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Raph1F2Z3U3 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Raph1F2Z3U3 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Raph1F2Z3U3 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Raph1F2Z3U3 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Raph1F2Z3U3 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Raph1F2Z3U3 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Raph1F2Z3U3 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Raph1F2Z3U3 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Raph1F2Z3U3 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Raph1F2Z3U3 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Raph1F2Z3U3 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Raph1F2Z3U3 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Raph1F2Z3U3 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Raph1F2Z3U3 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Raph1F2Z3U3 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Raph1F2Z3U3 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Raph1F2Z3U3 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Raph1F2Z3U3 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Raph1F2Z3U3 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Raph1F2Z3U3 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Raph1F2Z3U3 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Raph1F2Z3U3 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Raph1F2Z3U3 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Raph1F2Z3U3 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Raph1F2Z3U3 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Raph1F2Z3U3 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Raph1F2Z3U3 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Raph1F2Z3U3 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Raph1F2Z3U3 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Raph1F2Z3U3 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Raph1F2Z3U3 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Raph1F2Z3U3 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Raph1F2Z3U3 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Raph1F2Z3U3 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Raph1F2Z3U3 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Raph1F2Z3U3 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Raph1F2Z3U3 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Raph1F2Z3U3 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Raph1F2Z3U3 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Raph1F2Z3U3 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Raph1F2Z3U3 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Raph1F2Z3U3 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Raph1F2Z3U3 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Raph1F2Z3U3 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Raph1F2Z3U3 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Raph1F2Z3U3 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Raph1F2Z3U3 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Raph1F2Z3U3 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Raph1F2Z3U3 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Raph1F2Z3U3 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Raph1F2Z3U3 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Raph1F2Z3U3 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Raph1F2Z3U3 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Raph1F2Z3U3 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Raph1F2Z3U3 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Raph1F2Z3U3 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Raph1F2Z3U3 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Raph1F2Z3U3 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Raph1F2Z3U3 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Raph1F2Z3U3 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Raph1F2Z3U3 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Raph1F2Z3U3 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Raph1F2Z3U3 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Raph1F2Z3U3 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Raph1F2Z3U3 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Raph1F2Z3U3 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Raph1F2Z3U3 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Raph1F2Z3U3 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Raph1F2Z3U3 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Raph1F2Z3U3 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Raph1F2Z3U3 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Raph1F2Z3U3 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Raph1F2Z3U3 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Raph1F2Z3U3 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Raph1F2Z3U3 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Raph1F2Z3U3 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Raph1F2Z3U3 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Raph1F2Z3U3 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Raph1F2Z3U3 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Raph1F2Z3U3 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Raph1F2Z3U3 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Raph1F2Z3U3 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Raph1F2Z3U3 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Raph1F2Z3U3 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Raph1F2Z3U3 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms