Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9U0

Usp17lb, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein B, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp17lbE9Q9U0 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp17lbE9Q9U0 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp17lbE9Q9U0 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp17lbE9Q9U0 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp17lbE9Q9U0 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp17lbE9Q9U0 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp17lbE9Q9U0 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp17lbE9Q9U0 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp17lbE9Q9U0 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp17lbE9Q9U0 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp17lbE9Q9U0 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp17lbE9Q9U0 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp17lbE9Q9U0 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp17lbE9Q9U0 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp17lbE9Q9U0 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp17lbE9Q9U0 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp17lbE9Q9U0 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp17lbE9Q9U0 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp17lbE9Q9U0 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp17lbE9Q9U0 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp17lbE9Q9U0 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp17lbE9Q9U0 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp17lbE9Q9U0 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp17lbE9Q9U0 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp17lbE9Q9U0 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp17lbE9Q9U0 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp17lbE9Q9U0 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp17lbE9Q9U0 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Usp17lbE9Q9U0 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Usp17lbE9Q9U0 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Usp17lbE9Q9U0 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Usp17lbE9Q9U0 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Usp17lbE9Q9U0 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Usp17lbE9Q9U0 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Usp17lbE9Q9U0 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Usp17lbE9Q9U0 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Usp17lbE9Q9U0 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Usp17lbE9Q9U0 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Usp17lbE9Q9U0 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Usp17lbE9Q9U0 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp17lbE9Q9U0 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp17lbE9Q9U0 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp17lbE9Q9U0 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp17lbE9Q9U0 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp17lbE9Q9U0 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp17lbE9Q9U0 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp17lbE9Q9U0 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp17lbE9Q9U0 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp17lbE9Q9U0 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp17lbE9Q9U0 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp17lbE9Q9U0 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp17lbE9Q9U0 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp17lbE9Q9U0 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp17lbE9Q9U0 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp17lbE9Q9U0 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp17lbE9Q9U0 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp17lbE9Q9U0 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp17lbE9Q9U0 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp17lbE9Q9U0 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp17lbE9Q9U0 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp17lbE9Q9U0 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp17lbE9Q9U0 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp17lbE9Q9U0 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp17lbE9Q9U0 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp17lbE9Q9U0 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp17lbE9Q9U0 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp17lbE9Q9U0 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp17lbE9Q9U0 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp17lbE9Q9U0 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp17lbE9Q9U0 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp17lbE9Q9U0 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp17lbE9Q9U0 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp17lbE9Q9U0 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp17lbE9Q9U0 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp17lbE9Q9U0 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp17lbE9Q9U0 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp17lbE9Q9U0 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp17lbE9Q9U0 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp17lbE9Q9U0 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp17lbE9Q9U0 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp17lbE9Q9U0 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp17lbE9Q9U0 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp17lbE9Q9U0 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp17lbE9Q9U0 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp17lbE9Q9U0 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp17lbE9Q9U0 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp17lbE9Q9U0 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp17lbE9Q9U0 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp17lbE9Q9U0 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp17lbE9Q9U0 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp17lbE9Q9U0 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp17lbE9Q9U0 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp17lbE9Q9U0 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp17lbE9Q9U0 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp17lbE9Q9U0 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp17lbE9Q9U0 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp17lbE9Q9U0 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp17lbE9Q9U0 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp17lbE9Q9U0 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp17lbE9Q9U0 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms