Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9Q6

Cdh18, Cadherin 18, mousemouse

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Length 790 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh18E9Q9Q6 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cdh18E9Q9Q6 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cdh18E9Q9Q6 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cdh18E9Q9Q6 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cdh18E9Q9Q6 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Cdh18E9Q9Q6 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cdh18E9Q9Q6 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cdh18E9Q9Q6 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
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Cdh18E9Q9Q6 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
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Cdh18E9Q9Q6 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
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Cdh18E9Q9Q6 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cdh18E9Q9Q6 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cdh18E9Q9Q6 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cdh18E9Q9Q6 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cdh18E9Q9Q6 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cdh18E9Q9Q6 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cdh18E9Q9Q6 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cdh18E9Q9Q6 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cdh18E9Q9Q6 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cdh18E9Q9Q6 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
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Cdh18E9Q9Q6 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cdh18E9Q9Q6 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cdh18E9Q9Q6 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cdh18E9Q9Q6 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
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Cdh18E9Q9Q6 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cdh18E9Q9Q6 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
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Cdh18E9Q9Q6 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cdh18E9Q9Q6 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cdh18E9Q9Q6 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cdh18E9Q9Q6 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cdh18E9Q9Q6 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
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Cdh18E9Q9Q6 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
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Cdh18E9Q9Q6 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
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Cdh18E9Q9Q6 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cdh18E9Q9Q6 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cdh18E9Q9Q6 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
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Cdh18E9Q9Q6 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cdh18E9Q9Q6 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cdh18E9Q9Q6 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cdh18E9Q9Q6 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cdh18E9Q9Q6 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cdh18E9Q9Q6 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cdh18E9Q9Q6 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cdh18E9Q9Q6 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cdh18E9Q9Q6 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cdh18E9Q9Q6 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cdh18E9Q9Q6 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Cdh18E9Q9Q6 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cdh18E9Q9Q6 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cdh18E9Q9Q6 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cdh18E9Q9Q6 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
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Cdh18E9Q9Q6 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cdh18E9Q9Q6 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cdh18E9Q9Q6 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cdh18E9Q9Q6 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
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