Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7L1

Urb2, URB2 ribosome biogenesis 2 homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Urb2E9Q7L1 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Urb2E9Q7L1 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Urb2E9Q7L1 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Urb2E9Q7L1 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Urb2E9Q7L1 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Urb2E9Q7L1 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Urb2E9Q7L1 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Urb2E9Q7L1 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Urb2E9Q7L1 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Urb2E9Q7L1 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Urb2E9Q7L1 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
Urb2E9Q7L1 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
Urb2E9Q7L1 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Urb2E9Q7L1 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Urb2E9Q7L1 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Urb2E9Q7L1 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Urb2E9Q7L1 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
Urb2E9Q7L1 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Urb2E9Q7L1 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Urb2E9Q7L1 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Urb2E9Q7L1 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Urb2E9Q7L1 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
Urb2E9Q7L1 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
Urb2E9Q7L1 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Urb2E9Q7L1 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Urb2E9Q7L1 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Urb2E9Q7L1 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.32
Urb2E9Q7L1 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
Urb2E9Q7L1 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
Urb2E9Q7L1 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
Urb2E9Q7L1 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
Urb2E9Q7L1 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
Urb2E9Q7L1 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Urb2E9Q7L1 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
Urb2E9Q7L1 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
Urb2E9Q7L1 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Urb2E9Q7L1 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Urb2E9Q7L1 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Urb2E9Q7L1 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Urb2E9Q7L1 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Urb2E9Q7L1 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Urb2E9Q7L1 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Urb2E9Q7L1 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
Urb2E9Q7L1 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
Urb2E9Q7L1 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Urb2E9Q7L1 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Urb2E9Q7L1 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Urb2E9Q7L1 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Urb2E9Q7L1 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Urb2E9Q7L1 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Urb2E9Q7L1 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Urb2E9Q7L1 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Urb2E9Q7L1 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Urb2E9Q7L1 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
Urb2E9Q7L1 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Urb2E9Q7L1 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Urb2E9Q7L1 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Urb2E9Q7L1 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Urb2E9Q7L1 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Urb2E9Q7L1 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
Urb2E9Q7L1 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC29.45■■■□□ 2.3
Urb2E9Q7L1 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Urb2E9Q7L1 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Urb2E9Q7L1 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Urb2E9Q7L1 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Urb2E9Q7L1 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Urb2E9Q7L1 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Urb2E9Q7L1 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Urb2E9Q7L1 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Urb2E9Q7L1 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Urb2E9Q7L1 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Urb2E9Q7L1 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Urb2E9Q7L1 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Urb2E9Q7L1 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Urb2E9Q7L1 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Urb2E9Q7L1 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
Urb2E9Q7L1 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Urb2E9Q7L1 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Urb2E9Q7L1 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Urb2E9Q7L1 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Urb2E9Q7L1 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Urb2E9Q7L1 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Urb2E9Q7L1 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Urb2E9Q7L1 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
Urb2E9Q7L1 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Urb2E9Q7L1 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Urb2E9Q7L1 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Urb2E9Q7L1 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Urb2E9Q7L1 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Urb2E9Q7L1 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Urb2E9Q7L1 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Urb2E9Q7L1 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Urb2E9Q7L1 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Urb2E9Q7L1 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Urb2E9Q7L1 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Urb2E9Q7L1 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Urb2E9Q7L1 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Urb2E9Q7L1 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Urb2E9Q7L1 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Urb2E9Q7L1 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms