Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6E9

Simc1, SUMO-interacting motifs-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Simc1E9Q6E9 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Simc1E9Q6E9 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Simc1E9Q6E9 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Simc1E9Q6E9 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Simc1E9Q6E9 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Simc1E9Q6E9 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Simc1E9Q6E9 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Simc1E9Q6E9 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Simc1E9Q6E9 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Simc1E9Q6E9 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Simc1E9Q6E9 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Simc1E9Q6E9 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Simc1E9Q6E9 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Simc1E9Q6E9 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Simc1E9Q6E9 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Simc1E9Q6E9 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Simc1E9Q6E9 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Simc1E9Q6E9 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Simc1E9Q6E9 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Simc1E9Q6E9 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Simc1E9Q6E9 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Simc1E9Q6E9 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Simc1E9Q6E9 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Simc1E9Q6E9 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Simc1E9Q6E9 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Simc1E9Q6E9 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Simc1E9Q6E9 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Simc1E9Q6E9 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Simc1E9Q6E9 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Simc1E9Q6E9 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Simc1E9Q6E9 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Simc1E9Q6E9 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Simc1E9Q6E9 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Simc1E9Q6E9 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Simc1E9Q6E9 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Simc1E9Q6E9 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Simc1E9Q6E9 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Simc1E9Q6E9 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Simc1E9Q6E9 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Simc1E9Q6E9 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Simc1E9Q6E9 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Simc1E9Q6E9 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Simc1E9Q6E9 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Simc1E9Q6E9 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Simc1E9Q6E9 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Simc1E9Q6E9 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Simc1E9Q6E9 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Simc1E9Q6E9 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Simc1E9Q6E9 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Simc1E9Q6E9 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Simc1E9Q6E9 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Simc1E9Q6E9 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Simc1E9Q6E9 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Simc1E9Q6E9 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Simc1E9Q6E9 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Simc1E9Q6E9 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Simc1E9Q6E9 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Simc1E9Q6E9 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Simc1E9Q6E9 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Simc1E9Q6E9 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Simc1E9Q6E9 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Simc1E9Q6E9 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Simc1E9Q6E9 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Simc1E9Q6E9 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Simc1E9Q6E9 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Simc1E9Q6E9 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Simc1E9Q6E9 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Simc1E9Q6E9 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Simc1E9Q6E9 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Simc1E9Q6E9 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Simc1E9Q6E9 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Simc1E9Q6E9 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Simc1E9Q6E9 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Simc1E9Q6E9 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Simc1E9Q6E9 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Simc1E9Q6E9 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Simc1E9Q6E9 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Simc1E9Q6E9 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Simc1E9Q6E9 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Simc1E9Q6E9 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Simc1E9Q6E9 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Simc1E9Q6E9 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Simc1E9Q6E9 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Simc1E9Q6E9 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Simc1E9Q6E9 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Simc1E9Q6E9 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Simc1E9Q6E9 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Simc1E9Q6E9 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Simc1E9Q6E9 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Simc1E9Q6E9 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Simc1E9Q6E9 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Simc1E9Q6E9 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Simc1E9Q6E9 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Simc1E9Q6E9 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Simc1E9Q6E9 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Simc1E9Q6E9 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Simc1E9Q6E9 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Simc1E9Q6E9 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Simc1E9Q6E9 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Simc1E9Q6E9 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms