Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6B2

Ccdc85c, Coiled-coil domain-containing protein 85C, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85cE9Q6B2 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc85cE9Q6B2 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc85cE9Q6B2 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc85cE9Q6B2 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc85cE9Q6B2 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc85cE9Q6B2 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc85cE9Q6B2 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc85cE9Q6B2 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc85cE9Q6B2 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc85cE9Q6B2 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc85cE9Q6B2 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc85cE9Q6B2 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc85cE9Q6B2 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc85cE9Q6B2 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc85cE9Q6B2 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc85cE9Q6B2 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc85cE9Q6B2 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc85cE9Q6B2 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc85cE9Q6B2 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc85cE9Q6B2 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc85cE9Q6B2 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc85cE9Q6B2 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc85cE9Q6B2 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc85cE9Q6B2 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc85cE9Q6B2 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc85cE9Q6B2 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc85cE9Q6B2 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc85cE9Q6B2 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc85cE9Q6B2 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc85cE9Q6B2 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc85cE9Q6B2 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc85cE9Q6B2 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc85cE9Q6B2 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc85cE9Q6B2 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc85cE9Q6B2 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc85cE9Q6B2 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc85cE9Q6B2 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc85cE9Q6B2 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc85cE9Q6B2 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc85cE9Q6B2 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc85cE9Q6B2 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc85cE9Q6B2 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc85cE9Q6B2 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc85cE9Q6B2 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc85cE9Q6B2 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc85cE9Q6B2 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc85cE9Q6B2 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc85cE9Q6B2 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc85cE9Q6B2 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc85cE9Q6B2 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc85cE9Q6B2 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc85cE9Q6B2 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc85cE9Q6B2 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc85cE9Q6B2 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc85cE9Q6B2 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc85cE9Q6B2 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc85cE9Q6B2 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc85cE9Q6B2 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc85cE9Q6B2 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc85cE9Q6B2 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc85cE9Q6B2 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc85cE9Q6B2 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc85cE9Q6B2 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc85cE9Q6B2 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc85cE9Q6B2 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc85cE9Q6B2 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc85cE9Q6B2 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc85cE9Q6B2 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc85cE9Q6B2 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc85cE9Q6B2 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ccdc85cE9Q6B2 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ccdc85cE9Q6B2 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ccdc85cE9Q6B2 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc85cE9Q6B2 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc85cE9Q6B2 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc85cE9Q6B2 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc85cE9Q6B2 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc85cE9Q6B2 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc85cE9Q6B2 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc85cE9Q6B2 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc85cE9Q6B2 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc85cE9Q6B2 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc85cE9Q6B2 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc85cE9Q6B2 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc85cE9Q6B2 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc85cE9Q6B2 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc85cE9Q6B2 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc85cE9Q6B2 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc85cE9Q6B2 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc85cE9Q6B2 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc85cE9Q6B2 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc85cE9Q6B2 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc85cE9Q6B2 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc85cE9Q6B2 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc85cE9Q6B2 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc85cE9Q6B2 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc85cE9Q6B2 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc85cE9Q6B2 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc85cE9Q6B2 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc85cE9Q6B2 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms