Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5K9

Ythdc1, YTH domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ythdc1E9Q5K9 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ythdc1E9Q5K9 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ythdc1E9Q5K9 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ythdc1E9Q5K9 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ythdc1E9Q5K9 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ythdc1E9Q5K9 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ythdc1E9Q5K9 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ythdc1E9Q5K9 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ythdc1E9Q5K9 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Ythdc1E9Q5K9 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Ythdc1E9Q5K9 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Ythdc1E9Q5K9 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ythdc1E9Q5K9 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ythdc1E9Q5K9 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Ythdc1E9Q5K9 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ythdc1E9Q5K9 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ythdc1E9Q5K9 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ythdc1E9Q5K9 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Ythdc1E9Q5K9 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ythdc1E9Q5K9 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ythdc1E9Q5K9 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ythdc1E9Q5K9 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ythdc1E9Q5K9 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ythdc1E9Q5K9 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ythdc1E9Q5K9 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ythdc1E9Q5K9 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ythdc1E9Q5K9 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ythdc1E9Q5K9 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ythdc1E9Q5K9 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ythdc1E9Q5K9 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Ythdc1E9Q5K9 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ythdc1E9Q5K9 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ythdc1E9Q5K9 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ythdc1E9Q5K9 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ythdc1E9Q5K9 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ythdc1E9Q5K9 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ythdc1E9Q5K9 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ythdc1E9Q5K9 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ythdc1E9Q5K9 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Ythdc1E9Q5K9 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ythdc1E9Q5K9 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ythdc1E9Q5K9 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ythdc1E9Q5K9 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ythdc1E9Q5K9 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ythdc1E9Q5K9 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ythdc1E9Q5K9 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ythdc1E9Q5K9 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ythdc1E9Q5K9 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Ythdc1E9Q5K9 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ythdc1E9Q5K9 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ythdc1E9Q5K9 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ythdc1E9Q5K9 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ythdc1E9Q5K9 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ythdc1E9Q5K9 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ythdc1E9Q5K9 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ythdc1E9Q5K9 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ythdc1E9Q5K9 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ythdc1E9Q5K9 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ythdc1E9Q5K9 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ythdc1E9Q5K9 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ythdc1E9Q5K9 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ythdc1E9Q5K9 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ythdc1E9Q5K9 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ythdc1E9Q5K9 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ythdc1E9Q5K9 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ythdc1E9Q5K9 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ythdc1E9Q5K9 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ythdc1E9Q5K9 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ythdc1E9Q5K9 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Ythdc1E9Q5K9 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Ythdc1E9Q5K9 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ythdc1E9Q5K9 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ythdc1E9Q5K9 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ythdc1E9Q5K9 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ythdc1E9Q5K9 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ythdc1E9Q5K9 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ythdc1E9Q5K9 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ythdc1E9Q5K9 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ythdc1E9Q5K9 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ythdc1E9Q5K9 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ythdc1E9Q5K9 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ythdc1E9Q5K9 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ythdc1E9Q5K9 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ythdc1E9Q5K9 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ythdc1E9Q5K9 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ythdc1E9Q5K9 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ythdc1E9Q5K9 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ythdc1E9Q5K9 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ythdc1E9Q5K9 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ythdc1E9Q5K9 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ythdc1E9Q5K9 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ythdc1E9Q5K9 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ythdc1E9Q5K9 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ythdc1E9Q5K9 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ythdc1E9Q5K9 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ythdc1E9Q5K9 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ythdc1E9Q5K9 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ythdc1E9Q5K9 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ythdc1E9Q5K9 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ythdc1E9Q5K9 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms