Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5C9

Nolc1, Nucleolar and coiled-body phosphoprotein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 702 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nolc1E9Q5C9 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nolc1E9Q5C9 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Nolc1E9Q5C9 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nolc1E9Q5C9 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nolc1E9Q5C9 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nolc1E9Q5C9 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nolc1E9Q5C9 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nolc1E9Q5C9 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nolc1E9Q5C9 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nolc1E9Q5C9 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nolc1E9Q5C9 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nolc1E9Q5C9 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nolc1E9Q5C9 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nolc1E9Q5C9 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nolc1E9Q5C9 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Nolc1E9Q5C9 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nolc1E9Q5C9 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nolc1E9Q5C9 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nolc1E9Q5C9 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nolc1E9Q5C9 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nolc1E9Q5C9 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nolc1E9Q5C9 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nolc1E9Q5C9 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nolc1E9Q5C9 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nolc1E9Q5C9 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nolc1E9Q5C9 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nolc1E9Q5C9 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nolc1E9Q5C9 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nolc1E9Q5C9 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nolc1E9Q5C9 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nolc1E9Q5C9 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nolc1E9Q5C9 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nolc1E9Q5C9 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nolc1E9Q5C9 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nolc1E9Q5C9 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nolc1E9Q5C9 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Nolc1E9Q5C9 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nolc1E9Q5C9 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nolc1E9Q5C9 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nolc1E9Q5C9 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nolc1E9Q5C9 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nolc1E9Q5C9 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nolc1E9Q5C9 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nolc1E9Q5C9 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nolc1E9Q5C9 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nolc1E9Q5C9 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Nolc1E9Q5C9 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nolc1E9Q5C9 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nolc1E9Q5C9 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nolc1E9Q5C9 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nolc1E9Q5C9 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nolc1E9Q5C9 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nolc1E9Q5C9 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nolc1E9Q5C9 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nolc1E9Q5C9 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nolc1E9Q5C9 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nolc1E9Q5C9 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nolc1E9Q5C9 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nolc1E9Q5C9 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nolc1E9Q5C9 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nolc1E9Q5C9 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nolc1E9Q5C9 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nolc1E9Q5C9 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nolc1E9Q5C9 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nolc1E9Q5C9 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nolc1E9Q5C9 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nolc1E9Q5C9 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nolc1E9Q5C9 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nolc1E9Q5C9 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nolc1E9Q5C9 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nolc1E9Q5C9 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Nolc1E9Q5C9 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Nolc1E9Q5C9 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Nolc1E9Q5C9 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nolc1E9Q5C9 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nolc1E9Q5C9 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nolc1E9Q5C9 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nolc1E9Q5C9 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nolc1E9Q5C9 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nolc1E9Q5C9 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nolc1E9Q5C9 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nolc1E9Q5C9 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nolc1E9Q5C9 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nolc1E9Q5C9 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nolc1E9Q5C9 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nolc1E9Q5C9 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nolc1E9Q5C9 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nolc1E9Q5C9 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nolc1E9Q5C9 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nolc1E9Q5C9 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nolc1E9Q5C9 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nolc1E9Q5C9 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nolc1E9Q5C9 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Nolc1E9Q5C9 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nolc1E9Q5C9 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nolc1E9Q5C9 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Nolc1E9Q5C9 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nolc1E9Q5C9 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nolc1E9Q5C9 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nolc1E9Q5C9 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms