Protein–RNA interactions for Protein: E9Q548

Gm20518, Predicted gene 20518, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20518E9Q548 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm20518E9Q548 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm20518E9Q548 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm20518E9Q548 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm20518E9Q548 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm20518E9Q548 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm20518E9Q548 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm20518E9Q548 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm20518E9Q548 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm20518E9Q548 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm20518E9Q548 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm20518E9Q548 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm20518E9Q548 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm20518E9Q548 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm20518E9Q548 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm20518E9Q548 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm20518E9Q548 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm20518E9Q548 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm20518E9Q548 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm20518E9Q548 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm20518E9Q548 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm20518E9Q548 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm20518E9Q548 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm20518E9Q548 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm20518E9Q548 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm20518E9Q548 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm20518E9Q548 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm20518E9Q548 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm20518E9Q548 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm20518E9Q548 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm20518E9Q548 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm20518E9Q548 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm20518E9Q548 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm20518E9Q548 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm20518E9Q548 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm20518E9Q548 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm20518E9Q548 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm20518E9Q548 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm20518E9Q548 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm20518E9Q548 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm20518E9Q548 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm20518E9Q548 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm20518E9Q548 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm20518E9Q548 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm20518E9Q548 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm20518E9Q548 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm20518E9Q548 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm20518E9Q548 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm20518E9Q548 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm20518E9Q548 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm20518E9Q548 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm20518E9Q548 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm20518E9Q548 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm20518E9Q548 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm20518E9Q548 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm20518E9Q548 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm20518E9Q548 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm20518E9Q548 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm20518E9Q548 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm20518E9Q548 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm20518E9Q548 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm20518E9Q548 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm20518E9Q548 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm20518E9Q548 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm20518E9Q548 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm20518E9Q548 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm20518E9Q548 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm20518E9Q548 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm20518E9Q548 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm20518E9Q548 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm20518E9Q548 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm20518E9Q548 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm20518E9Q548 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm20518E9Q548 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm20518E9Q548 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm20518E9Q548 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm20518E9Q548 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm20518E9Q548 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm20518E9Q548 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm20518E9Q548 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm20518E9Q548 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm20518E9Q548 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm20518E9Q548 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm20518E9Q548 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm20518E9Q548 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm20518E9Q548 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm20518E9Q548 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm20518E9Q548 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm20518E9Q548 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm20518E9Q548 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm20518E9Q548 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm20518E9Q548 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm20518E9Q548 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm20518E9Q548 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm20518E9Q548 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm20518E9Q548 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm20518E9Q548 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm20518E9Q548 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm20518E9Q548 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm20518E9Q548 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms