Protein–RNA interactions for Protein: E9Q368

Tarbp1, TAR RNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tarbp1E9Q368 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Tarbp1E9Q368 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Tarbp1E9Q368 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Tarbp1E9Q368 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Tarbp1E9Q368 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Tarbp1E9Q368 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Tarbp1E9Q368 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Tarbp1E9Q368 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Tarbp1E9Q368 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Tarbp1E9Q368 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Tarbp1E9Q368 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Tarbp1E9Q368 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Tarbp1E9Q368 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Tarbp1E9Q368 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Tarbp1E9Q368 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Tarbp1E9Q368 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Tarbp1E9Q368 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Tarbp1E9Q368 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Tarbp1E9Q368 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Tarbp1E9Q368 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Tarbp1E9Q368 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Tarbp1E9Q368 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Tarbp1E9Q368 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Tarbp1E9Q368 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Tarbp1E9Q368 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Tarbp1E9Q368 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Tarbp1E9Q368 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Tarbp1E9Q368 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Tarbp1E9Q368 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Tarbp1E9Q368 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Tarbp1E9Q368 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Tarbp1E9Q368 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Tarbp1E9Q368 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Tarbp1E9Q368 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Tarbp1E9Q368 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Tarbp1E9Q368 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Tarbp1E9Q368 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Tarbp1E9Q368 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Tarbp1E9Q368 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Tarbp1E9Q368 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Tarbp1E9Q368 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Tarbp1E9Q368 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Tarbp1E9Q368 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Tarbp1E9Q368 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Tarbp1E9Q368 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Tarbp1E9Q368 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Tarbp1E9Q368 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Tarbp1E9Q368 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Tarbp1E9Q368 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Tarbp1E9Q368 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Tarbp1E9Q368 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Tarbp1E9Q368 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Tarbp1E9Q368 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Tarbp1E9Q368 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Tarbp1E9Q368 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Tarbp1E9Q368 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Tarbp1E9Q368 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Tarbp1E9Q368 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Tarbp1E9Q368 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Tarbp1E9Q368 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Tarbp1E9Q368 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Tarbp1E9Q368 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Tarbp1E9Q368 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Tarbp1E9Q368 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Tarbp1E9Q368 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Tarbp1E9Q368 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Tarbp1E9Q368 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Tarbp1E9Q368 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Tarbp1E9Q368 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Tarbp1E9Q368 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Tarbp1E9Q368 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Tarbp1E9Q368 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Tarbp1E9Q368 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Tarbp1E9Q368 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Tarbp1E9Q368 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Tarbp1E9Q368 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Tarbp1E9Q368 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Tarbp1E9Q368 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tarbp1E9Q368 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tarbp1E9Q368 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tarbp1E9Q368 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tarbp1E9Q368 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tarbp1E9Q368 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tarbp1E9Q368 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tarbp1E9Q368 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tarbp1E9Q368 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tarbp1E9Q368 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tarbp1E9Q368 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tarbp1E9Q368 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tarbp1E9Q368 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tarbp1E9Q368 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tarbp1E9Q368 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tarbp1E9Q368 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tarbp1E9Q368 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Tarbp1E9Q368 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tarbp1E9Q368 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tarbp1E9Q368 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tarbp1E9Q368 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tarbp1E9Q368 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tarbp1E9Q368 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms