Protein–RNA interactions for Protein: E9Q2E4

Hectd4, HECT domain E3 ubiquitin protein ligase 4, mousemouse

Predictions only

Length 4,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hectd4E9Q2E4 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Hectd4E9Q2E4 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hectd4E9Q2E4 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hectd4E9Q2E4 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Hectd4E9Q2E4 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Hectd4E9Q2E4 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hectd4E9Q2E4 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hectd4E9Q2E4 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hectd4E9Q2E4 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Hectd4E9Q2E4 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hectd4E9Q2E4 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hectd4E9Q2E4 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Hectd4E9Q2E4 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hectd4E9Q2E4 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hectd4E9Q2E4 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Hectd4E9Q2E4 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Hectd4E9Q2E4 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hectd4E9Q2E4 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hectd4E9Q2E4 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hectd4E9Q2E4 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hectd4E9Q2E4 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hectd4E9Q2E4 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Hectd4E9Q2E4 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hectd4E9Q2E4 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hectd4E9Q2E4 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hectd4E9Q2E4 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hectd4E9Q2E4 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hectd4E9Q2E4 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hectd4E9Q2E4 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Hectd4E9Q2E4 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hectd4E9Q2E4 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Hectd4E9Q2E4 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hectd4E9Q2E4 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hectd4E9Q2E4 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hectd4E9Q2E4 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hectd4E9Q2E4 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hectd4E9Q2E4 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hectd4E9Q2E4 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hectd4E9Q2E4 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hectd4E9Q2E4 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Hectd4E9Q2E4 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hectd4E9Q2E4 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hectd4E9Q2E4 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hectd4E9Q2E4 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Hectd4E9Q2E4 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hectd4E9Q2E4 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hectd4E9Q2E4 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hectd4E9Q2E4 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hectd4E9Q2E4 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hectd4E9Q2E4 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hectd4E9Q2E4 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hectd4E9Q2E4 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Hectd4E9Q2E4 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hectd4E9Q2E4 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hectd4E9Q2E4 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hectd4E9Q2E4 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hectd4E9Q2E4 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Hectd4E9Q2E4 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hectd4E9Q2E4 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Hectd4E9Q2E4 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hectd4E9Q2E4 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hectd4E9Q2E4 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hectd4E9Q2E4 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hectd4E9Q2E4 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hectd4E9Q2E4 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hectd4E9Q2E4 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hectd4E9Q2E4 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hectd4E9Q2E4 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hectd4E9Q2E4 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Hectd4E9Q2E4 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hectd4E9Q2E4 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hectd4E9Q2E4 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hectd4E9Q2E4 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hectd4E9Q2E4 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hectd4E9Q2E4 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hectd4E9Q2E4 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hectd4E9Q2E4 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hectd4E9Q2E4 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hectd4E9Q2E4 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hectd4E9Q2E4 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Hectd4E9Q2E4 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Hectd4E9Q2E4 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Hectd4E9Q2E4 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hectd4E9Q2E4 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hectd4E9Q2E4 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hectd4E9Q2E4 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hectd4E9Q2E4 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hectd4E9Q2E4 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hectd4E9Q2E4 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Hectd4E9Q2E4 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hectd4E9Q2E4 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hectd4E9Q2E4 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hectd4E9Q2E4 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hectd4E9Q2E4 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hectd4E9Q2E4 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hectd4E9Q2E4 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Hectd4E9Q2E4 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hectd4E9Q2E4 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hectd4E9Q2E4 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Hectd4E9Q2E4 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms