Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1X6

6430550D23Rik, RIKEN cDNA 6430550D23 gene, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
6430550D23RikE9Q1X6 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
6430550D23RikE9Q1X6 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
6430550D23RikE9Q1X6 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
6430550D23RikE9Q1X6 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
6430550D23RikE9Q1X6 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
6430550D23RikE9Q1X6 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
6430550D23RikE9Q1X6 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
6430550D23RikE9Q1X6 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
6430550D23RikE9Q1X6 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
6430550D23RikE9Q1X6 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
6430550D23RikE9Q1X6 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
6430550D23RikE9Q1X6 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
6430550D23RikE9Q1X6 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
6430550D23RikE9Q1X6 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
6430550D23RikE9Q1X6 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
6430550D23RikE9Q1X6 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
6430550D23RikE9Q1X6 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
6430550D23RikE9Q1X6 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
6430550D23RikE9Q1X6 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
6430550D23RikE9Q1X6 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
6430550D23RikE9Q1X6 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
6430550D23RikE9Q1X6 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
6430550D23RikE9Q1X6 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
6430550D23RikE9Q1X6 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
6430550D23RikE9Q1X6 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
6430550D23RikE9Q1X6 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
6430550D23RikE9Q1X6 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
6430550D23RikE9Q1X6 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
6430550D23RikE9Q1X6 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
6430550D23RikE9Q1X6 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
6430550D23RikE9Q1X6 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
6430550D23RikE9Q1X6 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
6430550D23RikE9Q1X6 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
6430550D23RikE9Q1X6 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
6430550D23RikE9Q1X6 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
6430550D23RikE9Q1X6 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
6430550D23RikE9Q1X6 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
6430550D23RikE9Q1X6 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
6430550D23RikE9Q1X6 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
6430550D23RikE9Q1X6 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
6430550D23RikE9Q1X6 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
6430550D23RikE9Q1X6 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
6430550D23RikE9Q1X6 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
6430550D23RikE9Q1X6 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
6430550D23RikE9Q1X6 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
6430550D23RikE9Q1X6 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
6430550D23RikE9Q1X6 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
6430550D23RikE9Q1X6 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
6430550D23RikE9Q1X6 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
6430550D23RikE9Q1X6 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
6430550D23RikE9Q1X6 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
6430550D23RikE9Q1X6 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
6430550D23RikE9Q1X6 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
6430550D23RikE9Q1X6 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
6430550D23RikE9Q1X6 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
6430550D23RikE9Q1X6 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
6430550D23RikE9Q1X6 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
6430550D23RikE9Q1X6 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
6430550D23RikE9Q1X6 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
6430550D23RikE9Q1X6 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
6430550D23RikE9Q1X6 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
6430550D23RikE9Q1X6 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
6430550D23RikE9Q1X6 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
6430550D23RikE9Q1X6 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
6430550D23RikE9Q1X6 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
6430550D23RikE9Q1X6 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
6430550D23RikE9Q1X6 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
6430550D23RikE9Q1X6 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
6430550D23RikE9Q1X6 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
6430550D23RikE9Q1X6 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
6430550D23RikE9Q1X6 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
6430550D23RikE9Q1X6 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
6430550D23RikE9Q1X6 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
6430550D23RikE9Q1X6 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
6430550D23RikE9Q1X6 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
6430550D23RikE9Q1X6 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
6430550D23RikE9Q1X6 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
6430550D23RikE9Q1X6 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
6430550D23RikE9Q1X6 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
6430550D23RikE9Q1X6 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
6430550D23RikE9Q1X6 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
6430550D23RikE9Q1X6 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
6430550D23RikE9Q1X6 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
6430550D23RikE9Q1X6 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
6430550D23RikE9Q1X6 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
6430550D23RikE9Q1X6 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
6430550D23RikE9Q1X6 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
6430550D23RikE9Q1X6 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
6430550D23RikE9Q1X6 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
6430550D23RikE9Q1X6 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
6430550D23RikE9Q1X6 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
6430550D23RikE9Q1X6 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
6430550D23RikE9Q1X6 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
6430550D23RikE9Q1X6 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
6430550D23RikE9Q1X6 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
6430550D23RikE9Q1X6 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
6430550D23RikE9Q1X6 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
6430550D23RikE9Q1X6 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
6430550D23RikE9Q1X6 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
6430550D23RikE9Q1X6 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms