Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1W3

Neb, Nebulin, mousemouse

Predictions only

Length 7,152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NebE9Q1W3 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC4.97□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC4.97□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC4.97□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC4.96□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.61
NebE9Q1W3 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
NebE9Q1W3 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms