Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0V3

Vmn1r68, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r68E9Q0V3 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r68E9Q0V3 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r68E9Q0V3 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r68E9Q0V3 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r68E9Q0V3 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r68E9Q0V3 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r68E9Q0V3 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r68E9Q0V3 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r68E9Q0V3 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r68E9Q0V3 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r68E9Q0V3 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r68E9Q0V3 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r68E9Q0V3 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r68E9Q0V3 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r68E9Q0V3 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r68E9Q0V3 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r68E9Q0V3 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r68E9Q0V3 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r68E9Q0V3 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r68E9Q0V3 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r68E9Q0V3 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r68E9Q0V3 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r68E9Q0V3 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r68E9Q0V3 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r68E9Q0V3 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r68E9Q0V3 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r68E9Q0V3 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r68E9Q0V3 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r68E9Q0V3 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r68E9Q0V3 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r68E9Q0V3 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r68E9Q0V3 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r68E9Q0V3 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r68E9Q0V3 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r68E9Q0V3 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r68E9Q0V3 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r68E9Q0V3 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r68E9Q0V3 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r68E9Q0V3 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r68E9Q0V3 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r68E9Q0V3 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r68E9Q0V3 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r68E9Q0V3 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r68E9Q0V3 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r68E9Q0V3 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r68E9Q0V3 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r68E9Q0V3 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r68E9Q0V3 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r68E9Q0V3 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r68E9Q0V3 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r68E9Q0V3 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r68E9Q0V3 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r68E9Q0V3 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r68E9Q0V3 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vmn1r68E9Q0V3 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r68E9Q0V3 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r68E9Q0V3 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r68E9Q0V3 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r68E9Q0V3 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r68E9Q0V3 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r68E9Q0V3 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r68E9Q0V3 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r68E9Q0V3 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r68E9Q0V3 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r68E9Q0V3 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r68E9Q0V3 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vmn1r68E9Q0V3 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r68E9Q0V3 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r68E9Q0V3 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r68E9Q0V3 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r68E9Q0V3 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r68E9Q0V3 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r68E9Q0V3 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r68E9Q0V3 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r68E9Q0V3 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r68E9Q0V3 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r68E9Q0V3 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r68E9Q0V3 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r68E9Q0V3 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r68E9Q0V3 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r68E9Q0V3 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r68E9Q0V3 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r68E9Q0V3 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r68E9Q0V3 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn1r68E9Q0V3 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r68E9Q0V3 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r68E9Q0V3 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r68E9Q0V3 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r68E9Q0V3 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r68E9Q0V3 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r68E9Q0V3 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r68E9Q0V3 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r68E9Q0V3 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r68E9Q0V3 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r68E9Q0V3 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r68E9Q0V3 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r68E9Q0V3 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r68E9Q0V3 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r68E9Q0V3 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r68E9Q0V3 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms