Protein–RNA interactions for Protein: E9Q058

Gm3095, Predicted gene 3095, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3095E9Q058 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm3095E9Q058 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm3095E9Q058 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm3095E9Q058 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm3095E9Q058 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm3095E9Q058 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm3095E9Q058 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm3095E9Q058 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm3095E9Q058 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm3095E9Q058 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm3095E9Q058 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm3095E9Q058 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm3095E9Q058 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm3095E9Q058 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm3095E9Q058 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm3095E9Q058 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm3095E9Q058 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm3095E9Q058 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm3095E9Q058 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm3095E9Q058 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm3095E9Q058 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm3095E9Q058 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm3095E9Q058 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm3095E9Q058 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm3095E9Q058 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm3095E9Q058 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm3095E9Q058 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm3095E9Q058 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm3095E9Q058 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm3095E9Q058 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm3095E9Q058 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm3095E9Q058 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gm3095E9Q058 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm3095E9Q058 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm3095E9Q058 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm3095E9Q058 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm3095E9Q058 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm3095E9Q058 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm3095E9Q058 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm3095E9Q058 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm3095E9Q058 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm3095E9Q058 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm3095E9Q058 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm3095E9Q058 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm3095E9Q058 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm3095E9Q058 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm3095E9Q058 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm3095E9Q058 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gm3095E9Q058 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm3095E9Q058 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm3095E9Q058 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm3095E9Q058 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm3095E9Q058 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm3095E9Q058 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm3095E9Q058 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm3095E9Q058 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm3095E9Q058 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm3095E9Q058 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm3095E9Q058 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gm3095E9Q058 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm3095E9Q058 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm3095E9Q058 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm3095E9Q058 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm3095E9Q058 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm3095E9Q058 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm3095E9Q058 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm3095E9Q058 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm3095E9Q058 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm3095E9Q058 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm3095E9Q058 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm3095E9Q058 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm3095E9Q058 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm3095E9Q058 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm3095E9Q058 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gm3095E9Q058 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm3095E9Q058 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm3095E9Q058 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm3095E9Q058 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm3095E9Q058 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm3095E9Q058 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm3095E9Q058 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm3095E9Q058 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm3095E9Q058 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm3095E9Q058 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm3095E9Q058 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm3095E9Q058 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm3095E9Q058 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm3095E9Q058 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm3095E9Q058 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm3095E9Q058 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm3095E9Q058 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm3095E9Q058 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm3095E9Q058 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm3095E9Q058 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm3095E9Q058 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm3095E9Q058 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm3095E9Q058 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm3095E9Q058 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm3095E9Q058 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm3095E9Q058 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms