Protein–RNA interactions for Protein: E9Q053

Gm9972, Predicted gene 9972, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9972E9Q053 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm9972E9Q053 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm9972E9Q053 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm9972E9Q053 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm9972E9Q053 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm9972E9Q053 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm9972E9Q053 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm9972E9Q053 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm9972E9Q053 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm9972E9Q053 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm9972E9Q053 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm9972E9Q053 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm9972E9Q053 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm9972E9Q053 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm9972E9Q053 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm9972E9Q053 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm9972E9Q053 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm9972E9Q053 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm9972E9Q053 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm9972E9Q053 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm9972E9Q053 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm9972E9Q053 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm9972E9Q053 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm9972E9Q053 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm9972E9Q053 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm9972E9Q053 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm9972E9Q053 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm9972E9Q053 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm9972E9Q053 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm9972E9Q053 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm9972E9Q053 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm9972E9Q053 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm9972E9Q053 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm9972E9Q053 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm9972E9Q053 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm9972E9Q053 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm9972E9Q053 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm9972E9Q053 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm9972E9Q053 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm9972E9Q053 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm9972E9Q053 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm9972E9Q053 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm9972E9Q053 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm9972E9Q053 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm9972E9Q053 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm9972E9Q053 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm9972E9Q053 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm9972E9Q053 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm9972E9Q053 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm9972E9Q053 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm9972E9Q053 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm9972E9Q053 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm9972E9Q053 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm9972E9Q053 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm9972E9Q053 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm9972E9Q053 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm9972E9Q053 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm9972E9Q053 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm9972E9Q053 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm9972E9Q053 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm9972E9Q053 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm9972E9Q053 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm9972E9Q053 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm9972E9Q053 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm9972E9Q053 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm9972E9Q053 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm9972E9Q053 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm9972E9Q053 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm9972E9Q053 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm9972E9Q053 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm9972E9Q053 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm9972E9Q053 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm9972E9Q053 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm9972E9Q053 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm9972E9Q053 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm9972E9Q053 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm9972E9Q053 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm9972E9Q053 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm9972E9Q053 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm9972E9Q053 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm9972E9Q053 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm9972E9Q053 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm9972E9Q053 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm9972E9Q053 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm9972E9Q053 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm9972E9Q053 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm9972E9Q053 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm9972E9Q053 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm9972E9Q053 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm9972E9Q053 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm9972E9Q053 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm9972E9Q053 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm9972E9Q053 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm9972E9Q053 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm9972E9Q053 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm9972E9Q053 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm9972E9Q053 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm9972E9Q053 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm9972E9Q053 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm9972E9Q053 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms