Protein–RNA interactions for Protein: E9Q043

Fndc1, Fibronectin type III domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc1E9Q043 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Fndc1E9Q043 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Fndc1E9Q043 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Fndc1E9Q043 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Fndc1E9Q043 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Fndc1E9Q043 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Fndc1E9Q043 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Fndc1E9Q043 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Fndc1E9Q043 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Fndc1E9Q043 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Fndc1E9Q043 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Fndc1E9Q043 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Fndc1E9Q043 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Fndc1E9Q043 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Fndc1E9Q043 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Fndc1E9Q043 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Fndc1E9Q043 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Fndc1E9Q043 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Fndc1E9Q043 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Fndc1E9Q043 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Fndc1E9Q043 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Fndc1E9Q043 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Fndc1E9Q043 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Fndc1E9Q043 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Fndc1E9Q043 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Fndc1E9Q043 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Fndc1E9Q043 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Fndc1E9Q043 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Fndc1E9Q043 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Fndc1E9Q043 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Fndc1E9Q043 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Fndc1E9Q043 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Fndc1E9Q043 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Fndc1E9Q043 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Fndc1E9Q043 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Fndc1E9Q043 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Fndc1E9Q043 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Fndc1E9Q043 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Fndc1E9Q043 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Fndc1E9Q043 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Fndc1E9Q043 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Fndc1E9Q043 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Fndc1E9Q043 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Fndc1E9Q043 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Fndc1E9Q043 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Fndc1E9Q043 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Fndc1E9Q043 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Fndc1E9Q043 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Fndc1E9Q043 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Fndc1E9Q043 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Fndc1E9Q043 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Fndc1E9Q043 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Fndc1E9Q043 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Fndc1E9Q043 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Fndc1E9Q043 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Fndc1E9Q043 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Fndc1E9Q043 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Fndc1E9Q043 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Fndc1E9Q043 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Fndc1E9Q043 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Fndc1E9Q043 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Fndc1E9Q043 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Fndc1E9Q043 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Fndc1E9Q043 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
Fndc1E9Q043 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Fndc1E9Q043 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Fndc1E9Q043 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Fndc1E9Q043 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Fndc1E9Q043 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Fndc1E9Q043 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Fndc1E9Q043 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Fndc1E9Q043 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Fndc1E9Q043 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Fndc1E9Q043 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Fndc1E9Q043 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Fndc1E9Q043 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Fndc1E9Q043 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Fndc1E9Q043 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Fndc1E9Q043 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Fndc1E9Q043 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Fndc1E9Q043 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Fndc1E9Q043 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Fndc1E9Q043 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Fndc1E9Q043 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Fndc1E9Q043 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Fndc1E9Q043 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Fndc1E9Q043 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Fndc1E9Q043 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Fndc1E9Q043 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Fndc1E9Q043 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Fndc1E9Q043 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Fndc1E9Q043 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Fndc1E9Q043 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Fndc1E9Q043 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Fndc1E9Q043 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Fndc1E9Q043 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Fndc1E9Q043 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Fndc1E9Q043 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Fndc1E9Q043 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Fndc1E9Q043 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.7 ms