Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ0

Ryr1, Ryanodine receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 5,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ryr1E9PZQ0 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ryr1E9PZQ0 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ryr1E9PZQ0 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ryr1E9PZQ0 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ryr1E9PZQ0 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ryr1E9PZQ0 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ryr1E9PZQ0 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ryr1E9PZQ0 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ryr1E9PZQ0 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Ryr1E9PZQ0 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ryr1E9PZQ0 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ryr1E9PZQ0 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Ryr1E9PZQ0 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Ryr1E9PZQ0 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ryr1E9PZQ0 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ryr1E9PZQ0 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Ryr1E9PZQ0 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ryr1E9PZQ0 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Ryr1E9PZQ0 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ryr1E9PZQ0 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ryr1E9PZQ0 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ryr1E9PZQ0 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ryr1E9PZQ0 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ryr1E9PZQ0 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ryr1E9PZQ0 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Ryr1E9PZQ0 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ryr1E9PZQ0 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ryr1E9PZQ0 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ryr1E9PZQ0 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ryr1E9PZQ0 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Ryr1E9PZQ0 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ryr1E9PZQ0 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ryr1E9PZQ0 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ryr1E9PZQ0 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ryr1E9PZQ0 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ryr1E9PZQ0 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ryr1E9PZQ0 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ryr1E9PZQ0 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Ryr1E9PZQ0 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ryr1E9PZQ0 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ryr1E9PZQ0 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Ryr1E9PZQ0 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ryr1E9PZQ0 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ryr1E9PZQ0 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ryr1E9PZQ0 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ryr1E9PZQ0 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ryr1E9PZQ0 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ryr1E9PZQ0 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ryr1E9PZQ0 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Ryr1E9PZQ0 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ryr1E9PZQ0 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Ryr1E9PZQ0 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ryr1E9PZQ0 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ryr1E9PZQ0 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Ryr1E9PZQ0 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ryr1E9PZQ0 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ryr1E9PZQ0 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ryr1E9PZQ0 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ryr1E9PZQ0 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ryr1E9PZQ0 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ryr1E9PZQ0 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ryr1E9PZQ0 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ryr1E9PZQ0 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ryr1E9PZQ0 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ryr1E9PZQ0 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ryr1E9PZQ0 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Ryr1E9PZQ0 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ryr1E9PZQ0 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ryr1E9PZQ0 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ryr1E9PZQ0 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ryr1E9PZQ0 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ryr1E9PZQ0 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Ryr1E9PZQ0 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ryr1E9PZQ0 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ryr1E9PZQ0 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ryr1E9PZQ0 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ryr1E9PZQ0 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ryr1E9PZQ0 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ryr1E9PZQ0 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Ryr1E9PZQ0 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Ryr1E9PZQ0 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Ryr1E9PZQ0 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC11.77□□□□□ -0.52
Ryr1E9PZQ0 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC11.77□□□□□ -0.52
Ryr1E9PZQ0 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC11.77□□□□□ -0.52
Ryr1E9PZQ0 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Ryr1E9PZQ0 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Ryr1E9PZQ0 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ryr1E9PZQ0 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Ryr1E9PZQ0 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ryr1E9PZQ0 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ryr1E9PZQ0 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ryr1E9PZQ0 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ryr1E9PZQ0 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ryr1E9PZQ0 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ryr1E9PZQ0 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ryr1E9PZQ0 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ryr1E9PZQ0 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ryr1E9PZQ0 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ryr1E9PZQ0 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ryr1E9PZQ0 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.9 ms