Protein–RNA interactions for Protein: E9PZM7

Scaf11, SR-related CTD-associated factor 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf11E9PZM7 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Scaf11E9PZM7 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Scaf11E9PZM7 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Scaf11E9PZM7 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Scaf11E9PZM7 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Scaf11E9PZM7 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Scaf11E9PZM7 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Scaf11E9PZM7 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Scaf11E9PZM7 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Scaf11E9PZM7 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Scaf11E9PZM7 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Scaf11E9PZM7 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Scaf11E9PZM7 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Scaf11E9PZM7 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Scaf11E9PZM7 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Scaf11E9PZM7 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Scaf11E9PZM7 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Scaf11E9PZM7 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Scaf11E9PZM7 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Scaf11E9PZM7 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Scaf11E9PZM7 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Scaf11E9PZM7 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Scaf11E9PZM7 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Scaf11E9PZM7 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Scaf11E9PZM7 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Scaf11E9PZM7 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Scaf11E9PZM7 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Scaf11E9PZM7 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Scaf11E9PZM7 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Scaf11E9PZM7 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Scaf11E9PZM7 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Scaf11E9PZM7 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Scaf11E9PZM7 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Scaf11E9PZM7 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Scaf11E9PZM7 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Scaf11E9PZM7 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Scaf11E9PZM7 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Scaf11E9PZM7 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Scaf11E9PZM7 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Scaf11E9PZM7 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Scaf11E9PZM7 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Scaf11E9PZM7 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Scaf11E9PZM7 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Scaf11E9PZM7 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Scaf11E9PZM7 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Scaf11E9PZM7 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Scaf11E9PZM7 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Scaf11E9PZM7 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Scaf11E9PZM7 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Scaf11E9PZM7 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Scaf11E9PZM7 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Scaf11E9PZM7 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Scaf11E9PZM7 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Scaf11E9PZM7 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Scaf11E9PZM7 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Scaf11E9PZM7 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Scaf11E9PZM7 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Scaf11E9PZM7 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Scaf11E9PZM7 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Scaf11E9PZM7 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Scaf11E9PZM7 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Scaf11E9PZM7 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Scaf11E9PZM7 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Scaf11E9PZM7 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Scaf11E9PZM7 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Scaf11E9PZM7 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Scaf11E9PZM7 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Scaf11E9PZM7 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Scaf11E9PZM7 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Scaf11E9PZM7 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Scaf11E9PZM7 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Scaf11E9PZM7 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Scaf11E9PZM7 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Scaf11E9PZM7 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Scaf11E9PZM7 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Scaf11E9PZM7 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Scaf11E9PZM7 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Scaf11E9PZM7 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Scaf11E9PZM7 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Scaf11E9PZM7 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Scaf11E9PZM7 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Scaf11E9PZM7 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Scaf11E9PZM7 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Scaf11E9PZM7 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Scaf11E9PZM7 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Scaf11E9PZM7 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Scaf11E9PZM7 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Scaf11E9PZM7 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Scaf11E9PZM7 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Scaf11E9PZM7 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Scaf11E9PZM7 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Scaf11E9PZM7 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Scaf11E9PZM7 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Scaf11E9PZM7 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Scaf11E9PZM7 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Scaf11E9PZM7 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Scaf11E9PZM7 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Scaf11E9PZM7 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Scaf11E9PZM7 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Scaf11E9PZM7 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms