Protein–RNA interactions for Protein: E9PY46

Ift140, Intraflagellar transport protein 140 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift140E9PY46 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Ift140E9PY46 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Ift140E9PY46 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Ift140E9PY46 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Ift140E9PY46 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Ift140E9PY46 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Ift140E9PY46 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Ift140E9PY46 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Ift140E9PY46 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
Ift140E9PY46 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Ift140E9PY46 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
Ift140E9PY46 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Ift140E9PY46 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Ift140E9PY46 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Ift140E9PY46 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Ift140E9PY46 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Ift140E9PY46 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Ift140E9PY46 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Ift140E9PY46 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Ift140E9PY46 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Ift140E9PY46 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Ift140E9PY46 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Ift140E9PY46 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Ift140E9PY46 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Ift140E9PY46 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Ift140E9PY46 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
Ift140E9PY46 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Ift140E9PY46 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Ift140E9PY46 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Ift140E9PY46 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Ift140E9PY46 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Ift140E9PY46 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Ift140E9PY46 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
Ift140E9PY46 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Ift140E9PY46 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Ift140E9PY46 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Ift140E9PY46 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Ift140E9PY46 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Ift140E9PY46 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Ift140E9PY46 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Ift140E9PY46 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Ift140E9PY46 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Ift140E9PY46 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Ift140E9PY46 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Ift140E9PY46 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Ift140E9PY46 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Ift140E9PY46 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Ift140E9PY46 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Ift140E9PY46 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Ift140E9PY46 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Ift140E9PY46 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Ift140E9PY46 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Ift140E9PY46 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ift140E9PY46 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ift140E9PY46 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
Ift140E9PY46 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
Ift140E9PY46 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ift140E9PY46 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ift140E9PY46 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ift140E9PY46 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ift140E9PY46 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ift140E9PY46 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ift140E9PY46 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ift140E9PY46 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ift140E9PY46 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ift140E9PY46 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
Ift140E9PY46 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Ift140E9PY46 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Ift140E9PY46 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Ift140E9PY46 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Ift140E9PY46 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Ift140E9PY46 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Ift140E9PY46 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Ift140E9PY46 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ift140E9PY46 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ift140E9PY46 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ift140E9PY46 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ift140E9PY46 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ift140E9PY46 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ift140E9PY46 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ift140E9PY46 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
Ift140E9PY46 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ift140E9PY46 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ift140E9PY46 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ift140E9PY46 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Ift140E9PY46 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Ift140E9PY46 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Ift140E9PY46 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Ift140E9PY46 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Ift140E9PY46 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Ift140E9PY46 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Ift140E9PY46 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Ift140E9PY46 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Ift140E9PY46 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Ift140E9PY46 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Ift140E9PY46 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Ift140E9PY46 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Ift140E9PY46 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Ift140E9PY46 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Ift140E9PY46 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms