Protein–RNA interactions for Protein: E9PWP9

4931408C20Rik, RIKEN cDNA 4931408C20 gene, mousemouse

Predictions only

Length 1,381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931408C20RikE9PWP9 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
4931408C20RikE9PWP9 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
4931408C20RikE9PWP9 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
4931408C20RikE9PWP9 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
4931408C20RikE9PWP9 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
4931408C20RikE9PWP9 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
4931408C20RikE9PWP9 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
4931408C20RikE9PWP9 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
4931408C20RikE9PWP9 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
4931408C20RikE9PWP9 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
4931408C20RikE9PWP9 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
4931408C20RikE9PWP9 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
4931408C20RikE9PWP9 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
4931408C20RikE9PWP9 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
4931408C20RikE9PWP9 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
4931408C20RikE9PWP9 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
4931408C20RikE9PWP9 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
4931408C20RikE9PWP9 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
4931408C20RikE9PWP9 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
4931408C20RikE9PWP9 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
4931408C20RikE9PWP9 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
4931408C20RikE9PWP9 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
4931408C20RikE9PWP9 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
4931408C20RikE9PWP9 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
4931408C20RikE9PWP9 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
4931408C20RikE9PWP9 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
4931408C20RikE9PWP9 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
4931408C20RikE9PWP9 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
4931408C20RikE9PWP9 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
4931408C20RikE9PWP9 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
4931408C20RikE9PWP9 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
4931408C20RikE9PWP9 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
4931408C20RikE9PWP9 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
4931408C20RikE9PWP9 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
4931408C20RikE9PWP9 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
4931408C20RikE9PWP9 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
4931408C20RikE9PWP9 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
4931408C20RikE9PWP9 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
4931408C20RikE9PWP9 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
4931408C20RikE9PWP9 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
4931408C20RikE9PWP9 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
4931408C20RikE9PWP9 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
4931408C20RikE9PWP9 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
4931408C20RikE9PWP9 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
4931408C20RikE9PWP9 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
4931408C20RikE9PWP9 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
4931408C20RikE9PWP9 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
4931408C20RikE9PWP9 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
4931408C20RikE9PWP9 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
4931408C20RikE9PWP9 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
4931408C20RikE9PWP9 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
4931408C20RikE9PWP9 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
4931408C20RikE9PWP9 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
4931408C20RikE9PWP9 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
4931408C20RikE9PWP9 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
4931408C20RikE9PWP9 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
4931408C20RikE9PWP9 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
4931408C20RikE9PWP9 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
4931408C20RikE9PWP9 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
4931408C20RikE9PWP9 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
4931408C20RikE9PWP9 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
4931408C20RikE9PWP9 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
4931408C20RikE9PWP9 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
4931408C20RikE9PWP9 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
4931408C20RikE9PWP9 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
4931408C20RikE9PWP9 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
4931408C20RikE9PWP9 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
4931408C20RikE9PWP9 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
4931408C20RikE9PWP9 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
4931408C20RikE9PWP9 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
4931408C20RikE9PWP9 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
4931408C20RikE9PWP9 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
4931408C20RikE9PWP9 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
4931408C20RikE9PWP9 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
4931408C20RikE9PWP9 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
4931408C20RikE9PWP9 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
4931408C20RikE9PWP9 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
4931408C20RikE9PWP9 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
4931408C20RikE9PWP9 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
4931408C20RikE9PWP9 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
4931408C20RikE9PWP9 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
4931408C20RikE9PWP9 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
4931408C20RikE9PWP9 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
4931408C20RikE9PWP9 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
4931408C20RikE9PWP9 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
4931408C20RikE9PWP9 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
4931408C20RikE9PWP9 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
4931408C20RikE9PWP9 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
4931408C20RikE9PWP9 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
4931408C20RikE9PWP9 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
4931408C20RikE9PWP9 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
4931408C20RikE9PWP9 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
4931408C20RikE9PWP9 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
4931408C20RikE9PWP9 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
4931408C20RikE9PWP9 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
4931408C20RikE9PWP9 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
4931408C20RikE9PWP9 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
4931408C20RikE9PWP9 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
4931408C20RikE9PWP9 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
4931408C20RikE9PWP9 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms