Protein–RNA interactions for Protein: E9PV98

Trim5, Tripartite motif-containing 5, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim5E9PV98 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trim5E9PV98 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Trim5E9PV98 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trim5E9PV98 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trim5E9PV98 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Trim5E9PV98 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trim5E9PV98 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trim5E9PV98 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trim5E9PV98 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trim5E9PV98 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trim5E9PV98 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trim5E9PV98 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Trim5E9PV98 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trim5E9PV98 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Trim5E9PV98 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trim5E9PV98 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trim5E9PV98 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trim5E9PV98 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trim5E9PV98 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trim5E9PV98 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trim5E9PV98 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trim5E9PV98 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trim5E9PV98 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trim5E9PV98 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trim5E9PV98 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trim5E9PV98 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trim5E9PV98 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trim5E9PV98 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trim5E9PV98 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Trim5E9PV98 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trim5E9PV98 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trim5E9PV98 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trim5E9PV98 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trim5E9PV98 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trim5E9PV98 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trim5E9PV98 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trim5E9PV98 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Trim5E9PV98 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trim5E9PV98 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trim5E9PV98 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trim5E9PV98 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trim5E9PV98 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trim5E9PV98 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trim5E9PV98 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trim5E9PV98 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trim5E9PV98 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trim5E9PV98 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trim5E9PV98 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trim5E9PV98 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trim5E9PV98 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trim5E9PV98 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trim5E9PV98 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Trim5E9PV98 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trim5E9PV98 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trim5E9PV98 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trim5E9PV98 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trim5E9PV98 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trim5E9PV98 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trim5E9PV98 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trim5E9PV98 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trim5E9PV98 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trim5E9PV98 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trim5E9PV98 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trim5E9PV98 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trim5E9PV98 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trim5E9PV98 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trim5E9PV98 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trim5E9PV98 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trim5E9PV98 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trim5E9PV98 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trim5E9PV98 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trim5E9PV98 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trim5E9PV98 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trim5E9PV98 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trim5E9PV98 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trim5E9PV98 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trim5E9PV98 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trim5E9PV98 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trim5E9PV98 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trim5E9PV98 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trim5E9PV98 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trim5E9PV98 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trim5E9PV98 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trim5E9PV98 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Trim5E9PV98 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trim5E9PV98 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trim5E9PV98 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trim5E9PV98 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trim5E9PV98 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trim5E9PV98 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Trim5E9PV98 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Trim5E9PV98 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trim5E9PV98 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trim5E9PV98 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trim5E9PV98 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trim5E9PV98 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trim5E9PV98 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trim5E9PV98 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trim5E9PV98 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Trim5E9PV98 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms